Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUA4

GTF3C2, General transcription factor 3C polypeptide 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2Q8WUA4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
GTF3C2Q8WUA4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GTF3C2Q8WUA4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GTF3C2Q8WUA4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GTF3C2Q8WUA4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GTF3C2Q8WUA4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GTF3C2Q8WUA4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GTF3C2Q8WUA4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GTF3C2Q8WUA4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GTF3C2Q8WUA4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
GTF3C2Q8WUA4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GTF3C2Q8WUA4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GTF3C2Q8WUA4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GTF3C2Q8WUA4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GTF3C2Q8WUA4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GTF3C2Q8WUA4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GTF3C2Q8WUA4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GTF3C2Q8WUA4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GTF3C2Q8WUA4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GTF3C2Q8WUA4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GTF3C2Q8WUA4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GTF3C2Q8WUA4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GTF3C2Q8WUA4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GTF3C2Q8WUA4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
GTF3C2Q8WUA4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GTF3C2Q8WUA4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GTF3C2Q8WUA4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GTF3C2Q8WUA4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GTF3C2Q8WUA4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GTF3C2Q8WUA4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
GTF3C2Q8WUA4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GTF3C2Q8WUA4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GTF3C2Q8WUA4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GTF3C2Q8WUA4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GTF3C2Q8WUA4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GTF3C2Q8WUA4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GTF3C2Q8WUA4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GTF3C2Q8WUA4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GTF3C2Q8WUA4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
GTF3C2Q8WUA4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GTF3C2Q8WUA4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GTF3C2Q8WUA4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GTF3C2Q8WUA4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GTF3C2Q8WUA4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GTF3C2Q8WUA4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GTF3C2Q8WUA4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GTF3C2Q8WUA4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GTF3C2Q8WUA4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GTF3C2Q8WUA4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GTF3C2Q8WUA4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GTF3C2Q8WUA4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
GTF3C2Q8WUA4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
GTF3C2Q8WUA4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GTF3C2Q8WUA4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GTF3C2Q8WUA4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GTF3C2Q8WUA4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GTF3C2Q8WUA4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GTF3C2Q8WUA4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GTF3C2Q8WUA4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
GTF3C2Q8WUA4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GTF3C2Q8WUA4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GTF3C2Q8WUA4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GTF3C2Q8WUA4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GTF3C2Q8WUA4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GTF3C2Q8WUA4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GTF3C2Q8WUA4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GTF3C2Q8WUA4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GTF3C2Q8WUA4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF3C2Q8WUA4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF3C2Q8WUA4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF3C2Q8WUA4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF3C2Q8WUA4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF3C2Q8WUA4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GTF3C2Q8WUA4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GTF3C2Q8WUA4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GTF3C2Q8WUA4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GTF3C2Q8WUA4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GTF3C2Q8WUA4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GTF3C2Q8WUA4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GTF3C2Q8WUA4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GTF3C2Q8WUA4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
GTF3C2Q8WUA4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GTF3C2Q8WUA4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GTF3C2Q8WUA4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GTF3C2Q8WUA4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
GTF3C2Q8WUA4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GTF3C2Q8WUA4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GTF3C2Q8WUA4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
GTF3C2Q8WUA4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GTF3C2Q8WUA4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GTF3C2Q8WUA4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GTF3C2Q8WUA4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
GTF3C2Q8WUA4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GTF3C2Q8WUA4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GTF3C2Q8WUA4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GTF3C2Q8WUA4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GTF3C2Q8WUA4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GTF3C2Q8WUA4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GTF3C2Q8WUA4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GTF3C2Q8WUA4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms