Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDW7

FAT3, Protocadherin Fat 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT3Q8TDW7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAT3Q8TDW7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAT3Q8TDW7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAT3Q8TDW7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAT3Q8TDW7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAT3Q8TDW7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FAT3Q8TDW7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAT3Q8TDW7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAT3Q8TDW7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAT3Q8TDW7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAT3Q8TDW7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAT3Q8TDW7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAT3Q8TDW7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAT3Q8TDW7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAT3Q8TDW7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAT3Q8TDW7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FAT3Q8TDW7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAT3Q8TDW7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAT3Q8TDW7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FAT3Q8TDW7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAT3Q8TDW7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAT3Q8TDW7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAT3Q8TDW7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAT3Q8TDW7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAT3Q8TDW7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
FAT3Q8TDW7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAT3Q8TDW7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
FAT3Q8TDW7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
FAT3Q8TDW7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
FAT3Q8TDW7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAT3Q8TDW7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
FAT3Q8TDW7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
FAT3Q8TDW7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAT3Q8TDW7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAT3Q8TDW7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAT3Q8TDW7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
FAT3Q8TDW7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAT3Q8TDW7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAT3Q8TDW7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAT3Q8TDW7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAT3Q8TDW7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAT3Q8TDW7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAT3Q8TDW7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAT3Q8TDW7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAT3Q8TDW7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAT3Q8TDW7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAT3Q8TDW7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAT3Q8TDW7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAT3Q8TDW7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAT3Q8TDW7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAT3Q8TDW7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAT3Q8TDW7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAT3Q8TDW7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAT3Q8TDW7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAT3Q8TDW7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAT3Q8TDW7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAT3Q8TDW7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FAT3Q8TDW7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAT3Q8TDW7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAT3Q8TDW7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAT3Q8TDW7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAT3Q8TDW7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAT3Q8TDW7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAT3Q8TDW7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAT3Q8TDW7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAT3Q8TDW7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAT3Q8TDW7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAT3Q8TDW7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAT3Q8TDW7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
FAT3Q8TDW7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAT3Q8TDW7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAT3Q8TDW7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAT3Q8TDW7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAT3Q8TDW7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAT3Q8TDW7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAT3Q8TDW7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAT3Q8TDW7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAT3Q8TDW7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAT3Q8TDW7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAT3Q8TDW7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAT3Q8TDW7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAT3Q8TDW7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
FAT3Q8TDW7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAT3Q8TDW7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAT3Q8TDW7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAT3Q8TDW7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAT3Q8TDW7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAT3Q8TDW7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAT3Q8TDW7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAT3Q8TDW7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
FAT3Q8TDW7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.1
FAT3Q8TDW7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.1
FAT3Q8TDW7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
FAT3Q8TDW7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FAT3Q8TDW7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FAT3Q8TDW7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FAT3Q8TDW7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FAT3Q8TDW7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FAT3Q8TDW7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FAT3Q8TDW7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms