Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD91

MAGEC3, Melanoma-associated antigen C3, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEC3Q8TD91 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAGEC3Q8TD91 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAGEC3Q8TD91 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAGEC3Q8TD91 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MAGEC3Q8TD91 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MAGEC3Q8TD91 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MAGEC3Q8TD91 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAGEC3Q8TD91 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAGEC3Q8TD91 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAGEC3Q8TD91 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MAGEC3Q8TD91 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAGEC3Q8TD91 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAGEC3Q8TD91 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAGEC3Q8TD91 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAGEC3Q8TD91 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAGEC3Q8TD91 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAGEC3Q8TD91 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAGEC3Q8TD91 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAGEC3Q8TD91 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAGEC3Q8TD91 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAGEC3Q8TD91 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAGEC3Q8TD91 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAGEC3Q8TD91 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAGEC3Q8TD91 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAGEC3Q8TD91 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAGEC3Q8TD91 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAGEC3Q8TD91 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MAGEC3Q8TD91 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAGEC3Q8TD91 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MAGEC3Q8TD91 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MAGEC3Q8TD91 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MAGEC3Q8TD91 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MAGEC3Q8TD91 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MAGEC3Q8TD91 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MAGEC3Q8TD91 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAGEC3Q8TD91 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAGEC3Q8TD91 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAGEC3Q8TD91 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAGEC3Q8TD91 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MAGEC3Q8TD91 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAGEC3Q8TD91 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAGEC3Q8TD91 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAGEC3Q8TD91 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms