Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD91

MAGEC3, Melanoma-associated antigen C3, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEC3Q8TD91 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAGEC3Q8TD91 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAGEC3Q8TD91 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAGEC3Q8TD91 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MAGEC3Q8TD91 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MAGEC3Q8TD91 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MAGEC3Q8TD91 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAGEC3Q8TD91 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAGEC3Q8TD91 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAGEC3Q8TD91 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAGEC3Q8TD91 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MAGEC3Q8TD91 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAGEC3Q8TD91 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAGEC3Q8TD91 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAGEC3Q8TD91 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAGEC3Q8TD91 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAGEC3Q8TD91 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAGEC3Q8TD91 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAGEC3Q8TD91 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAGEC3Q8TD91 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAGEC3Q8TD91 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAGEC3Q8TD91 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAGEC3Q8TD91 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAGEC3Q8TD91 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAGEC3Q8TD91 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAGEC3Q8TD91 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAGEC3Q8TD91 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAGEC3Q8TD91 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MAGEC3Q8TD91 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAGEC3Q8TD91 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MAGEC3Q8TD91 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MAGEC3Q8TD91 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MAGEC3Q8TD91 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MAGEC3Q8TD91 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MAGEC3Q8TD91 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MAGEC3Q8TD91 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAGEC3Q8TD91 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAGEC3Q8TD91 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAGEC3Q8TD91 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAGEC3Q8TD91 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MAGEC3Q8TD91 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAGEC3Q8TD91 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAGEC3Q8TD91 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAGEC3Q8TD91 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms