Protein–RNA interactions for Protein: Q8NI22

MCFD2, Multiple coagulation factor deficiency protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCFD2Q8NI22 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCFD2Q8NI22 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCFD2Q8NI22 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCFD2Q8NI22 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCFD2Q8NI22 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCFD2Q8NI22 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCFD2Q8NI22 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCFD2Q8NI22 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCFD2Q8NI22 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCFD2Q8NI22 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCFD2Q8NI22 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCFD2Q8NI22 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCFD2Q8NI22 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCFD2Q8NI22 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCFD2Q8NI22 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCFD2Q8NI22 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCFD2Q8NI22 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCFD2Q8NI22 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCFD2Q8NI22 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCFD2Q8NI22 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCFD2Q8NI22 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCFD2Q8NI22 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCFD2Q8NI22 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCFD2Q8NI22 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCFD2Q8NI22 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCFD2Q8NI22 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCFD2Q8NI22 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCFD2Q8NI22 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCFD2Q8NI22 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCFD2Q8NI22 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCFD2Q8NI22 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCFD2Q8NI22 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCFD2Q8NI22 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCFD2Q8NI22 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCFD2Q8NI22 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCFD2Q8NI22 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCFD2Q8NI22 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCFD2Q8NI22 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCFD2Q8NI22 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCFD2Q8NI22 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCFD2Q8NI22 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCFD2Q8NI22 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCFD2Q8NI22 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCFD2Q8NI22 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCFD2Q8NI22 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MCFD2Q8NI22 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCFD2Q8NI22 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCFD2Q8NI22 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCFD2Q8NI22 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCFD2Q8NI22 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCFD2Q8NI22 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MCFD2Q8NI22 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MCFD2Q8NI22 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCFD2Q8NI22 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MCFD2Q8NI22 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCFD2Q8NI22 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCFD2Q8NI22 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCFD2Q8NI22 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCFD2Q8NI22 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCFD2Q8NI22 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCFD2Q8NI22 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCFD2Q8NI22 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCFD2Q8NI22 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCFD2Q8NI22 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCFD2Q8NI22 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCFD2Q8NI22 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCFD2Q8NI22 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCFD2Q8NI22 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCFD2Q8NI22 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCFD2Q8NI22 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCFD2Q8NI22 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCFD2Q8NI22 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MCFD2Q8NI22 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCFD2Q8NI22 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCFD2Q8NI22 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCFD2Q8NI22 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCFD2Q8NI22 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCFD2Q8NI22 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCFD2Q8NI22 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCFD2Q8NI22 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCFD2Q8NI22 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCFD2Q8NI22 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCFD2Q8NI22 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCFD2Q8NI22 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCFD2Q8NI22 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCFD2Q8NI22 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCFD2Q8NI22 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCFD2Q8NI22 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCFD2Q8NI22 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCFD2Q8NI22 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCFD2Q8NI22 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCFD2Q8NI22 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCFD2Q8NI22 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCFD2Q8NI22 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCFD2Q8NI22 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCFD2Q8NI22 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCFD2Q8NI22 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCFD2Q8NI22 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MCFD2Q8NI22 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MCFD2Q8NI22 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 199.2 ms