Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA6DQ8NFY4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA6DQ8NFY4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA6DQ8NFY4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA6DQ8NFY4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA6DQ8NFY4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA6DQ8NFY4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA6DQ8NFY4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA6DQ8NFY4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA6DQ8NFY4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA6DQ8NFY4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA6DQ8NFY4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA6DQ8NFY4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA6DQ8NFY4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SEMA6DQ8NFY4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA6DQ8NFY4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA6DQ8NFY4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA6DQ8NFY4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA6DQ8NFY4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA6DQ8NFY4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA6DQ8NFY4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA6DQ8NFY4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA6DQ8NFY4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA6DQ8NFY4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA6DQ8NFY4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA6DQ8NFY4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA6DQ8NFY4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA6DQ8NFY4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA6DQ8NFY4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA6DQ8NFY4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA6DQ8NFY4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA6DQ8NFY4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA6DQ8NFY4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA6DQ8NFY4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA6DQ8NFY4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA6DQ8NFY4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA6DQ8NFY4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA6DQ8NFY4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA6DQ8NFY4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA6DQ8NFY4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA6DQ8NFY4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA6DQ8NFY4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SEMA6DQ8NFY4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SEMA6DQ8NFY4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SEMA6DQ8NFY4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SEMA6DQ8NFY4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SEMA6DQ8NFY4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SEMA6DQ8NFY4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SEMA6DQ8NFY4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SEMA6DQ8NFY4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SEMA6DQ8NFY4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEMA6DQ8NFY4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEMA6DQ8NFY4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEMA6DQ8NFY4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEMA6DQ8NFY4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEMA6DQ8NFY4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEMA6DQ8NFY4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA6DQ8NFY4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA6DQ8NFY4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA6DQ8NFY4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA6DQ8NFY4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA6DQ8NFY4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA6DQ8NFY4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA6DQ8NFY4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA6DQ8NFY4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA6DQ8NFY4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA6DQ8NFY4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA6DQ8NFY4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA6DQ8NFY4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA6DQ8NFY4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA6DQ8NFY4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA6DQ8NFY4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA6DQ8NFY4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA6DQ8NFY4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA6DQ8NFY4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA6DQ8NFY4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA6DQ8NFY4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SEMA6DQ8NFY4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SEMA6DQ8NFY4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SEMA6DQ8NFY4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SEMA6DQ8NFY4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SEMA6DQ8NFY4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEMA6DQ8NFY4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEMA6DQ8NFY4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEMA6DQ8NFY4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEMA6DQ8NFY4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEMA6DQ8NFY4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEMA6DQ8NFY4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEMA6DQ8NFY4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA6DQ8NFY4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA6DQ8NFY4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA6DQ8NFY4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA6DQ8NFY4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA6DQ8NFY4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA6DQ8NFY4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA6DQ8NFY4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA6DQ8NFY4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA6DQ8NFY4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA6DQ8NFY4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA6DQ8NFY4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms