Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MYRIPQ8NFW9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
MYRIPQ8NFW9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MYRIPQ8NFW9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MYRIPQ8NFW9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MYRIPQ8NFW9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MYRIPQ8NFW9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MYRIPQ8NFW9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MYRIPQ8NFW9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MYRIPQ8NFW9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MYRIPQ8NFW9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MYRIPQ8NFW9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MYRIPQ8NFW9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MYRIPQ8NFW9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MYRIPQ8NFW9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
MYRIPQ8NFW9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MYRIPQ8NFW9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MYRIPQ8NFW9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MYRIPQ8NFW9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MYRIPQ8NFW9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MYRIPQ8NFW9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MYRIPQ8NFW9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MYRIPQ8NFW9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MYRIPQ8NFW9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MYRIPQ8NFW9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MYRIPQ8NFW9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MYRIPQ8NFW9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MYRIPQ8NFW9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MYRIPQ8NFW9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MYRIPQ8NFW9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MYRIPQ8NFW9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MYRIPQ8NFW9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MYRIPQ8NFW9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MYRIPQ8NFW9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MYRIPQ8NFW9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MYRIPQ8NFW9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MYRIPQ8NFW9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MYRIPQ8NFW9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MYRIPQ8NFW9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MYRIPQ8NFW9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MYRIPQ8NFW9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MYRIPQ8NFW9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MYRIPQ8NFW9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MYRIPQ8NFW9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MYRIPQ8NFW9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MYRIPQ8NFW9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MYRIPQ8NFW9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYRIPQ8NFW9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYRIPQ8NFW9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYRIPQ8NFW9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYRIPQ8NFW9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYRIPQ8NFW9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYRIPQ8NFW9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYRIPQ8NFW9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYRIPQ8NFW9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYRIPQ8NFW9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYRIPQ8NFW9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYRIPQ8NFW9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYRIPQ8NFW9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYRIPQ8NFW9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
MYRIPQ8NFW9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MYRIPQ8NFW9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MYRIPQ8NFW9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MYRIPQ8NFW9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MYRIPQ8NFW9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MYRIPQ8NFW9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MYRIPQ8NFW9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MYRIPQ8NFW9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MYRIPQ8NFW9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MYRIPQ8NFW9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MYRIPQ8NFW9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MYRIPQ8NFW9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MYRIPQ8NFW9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MYRIPQ8NFW9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MYRIPQ8NFW9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MYRIPQ8NFW9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MYRIPQ8NFW9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MYRIPQ8NFW9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MYRIPQ8NFW9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYRIPQ8NFW9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYRIPQ8NFW9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYRIPQ8NFW9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYRIPQ8NFW9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYRIPQ8NFW9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYRIPQ8NFW9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MYRIPQ8NFW9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MYRIPQ8NFW9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MYRIPQ8NFW9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MYRIPQ8NFW9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MYRIPQ8NFW9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MYRIPQ8NFW9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MYRIPQ8NFW9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MYRIPQ8NFW9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
MYRIPQ8NFW9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MYRIPQ8NFW9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MYRIPQ8NFW9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MYRIPQ8NFW9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MYRIPQ8NFW9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MYRIPQ8NFW9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MYRIPQ8NFW9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.4 ms