Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF37

LPCAT1, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT1Q8NF37 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LPCAT1Q8NF37 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LPCAT1Q8NF37 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LPCAT1Q8NF37 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LPCAT1Q8NF37 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LPCAT1Q8NF37 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LPCAT1Q8NF37 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LPCAT1Q8NF37 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LPCAT1Q8NF37 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LPCAT1Q8NF37 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LPCAT1Q8NF37 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LPCAT1Q8NF37 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LPCAT1Q8NF37 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LPCAT1Q8NF37 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LPCAT1Q8NF37 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LPCAT1Q8NF37 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LPCAT1Q8NF37 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LPCAT1Q8NF37 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LPCAT1Q8NF37 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LPCAT1Q8NF37 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LPCAT1Q8NF37 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LPCAT1Q8NF37 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LPCAT1Q8NF37 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LPCAT1Q8NF37 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LPCAT1Q8NF37 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LPCAT1Q8NF37 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LPCAT1Q8NF37 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LPCAT1Q8NF37 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LPCAT1Q8NF37 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LPCAT1Q8NF37 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LPCAT1Q8NF37 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LPCAT1Q8NF37 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LPCAT1Q8NF37 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LPCAT1Q8NF37 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LPCAT1Q8NF37 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LPCAT1Q8NF37 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LPCAT1Q8NF37 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LPCAT1Q8NF37 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LPCAT1Q8NF37 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LPCAT1Q8NF37 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LPCAT1Q8NF37 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LPCAT1Q8NF37 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LPCAT1Q8NF37 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LPCAT1Q8NF37 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LPCAT1Q8NF37 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LPCAT1Q8NF37 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LPCAT1Q8NF37 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LPCAT1Q8NF37 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LPCAT1Q8NF37 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LPCAT1Q8NF37 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LPCAT1Q8NF37 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LPCAT1Q8NF37 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LPCAT1Q8NF37 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LPCAT1Q8NF37 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LPCAT1Q8NF37 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LPCAT1Q8NF37 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LPCAT1Q8NF37 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LPCAT1Q8NF37 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LPCAT1Q8NF37 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LPCAT1Q8NF37 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LPCAT1Q8NF37 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LPCAT1Q8NF37 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LPCAT1Q8NF37 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LPCAT1Q8NF37 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LPCAT1Q8NF37 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LPCAT1Q8NF37 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LPCAT1Q8NF37 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LPCAT1Q8NF37 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LPCAT1Q8NF37 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LPCAT1Q8NF37 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LPCAT1Q8NF37 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LPCAT1Q8NF37 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LPCAT1Q8NF37 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LPCAT1Q8NF37 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LPCAT1Q8NF37 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LPCAT1Q8NF37 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LPCAT1Q8NF37 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LPCAT1Q8NF37 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LPCAT1Q8NF37 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LPCAT1Q8NF37 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LPCAT1Q8NF37 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LPCAT1Q8NF37 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LPCAT1Q8NF37 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LPCAT1Q8NF37 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LPCAT1Q8NF37 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LPCAT1Q8NF37 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LPCAT1Q8NF37 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LPCAT1Q8NF37 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LPCAT1Q8NF37 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LPCAT1Q8NF37 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LPCAT1Q8NF37 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LPCAT1Q8NF37 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LPCAT1Q8NF37 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LPCAT1Q8NF37 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LPCAT1Q8NF37 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LPCAT1Q8NF37 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LPCAT1Q8NF37 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LPCAT1Q8NF37 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
LPCAT1Q8NF37 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LPCAT1Q8NF37 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms