Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3C3Q8NEB9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3C3Q8NEB9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3C3Q8NEB9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3C3Q8NEB9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3C3Q8NEB9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIK3C3Q8NEB9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIK3C3Q8NEB9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIK3C3Q8NEB9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIK3C3Q8NEB9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3C3Q8NEB9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3C3Q8NEB9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3C3Q8NEB9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3C3Q8NEB9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3C3Q8NEB9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3C3Q8NEB9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3C3Q8NEB9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3C3Q8NEB9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3C3Q8NEB9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3C3Q8NEB9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3C3Q8NEB9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3C3Q8NEB9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3C3Q8NEB9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3C3Q8NEB9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3C3Q8NEB9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3C3Q8NEB9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3C3Q8NEB9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3C3Q8NEB9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3C3Q8NEB9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3C3Q8NEB9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3C3Q8NEB9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3C3Q8NEB9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3C3Q8NEB9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3C3Q8NEB9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3C3Q8NEB9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3C3Q8NEB9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3C3Q8NEB9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3C3Q8NEB9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3C3Q8NEB9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3C3Q8NEB9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3C3Q8NEB9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3C3Q8NEB9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3C3Q8NEB9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3C3Q8NEB9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3C3Q8NEB9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3C3Q8NEB9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3C3Q8NEB9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3C3Q8NEB9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3C3Q8NEB9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3C3Q8NEB9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3C3Q8NEB9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3C3Q8NEB9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3C3Q8NEB9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3C3Q8NEB9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3C3Q8NEB9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3C3Q8NEB9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3C3Q8NEB9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3C3Q8NEB9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3C3Q8NEB9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3C3Q8NEB9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3C3Q8NEB9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3C3Q8NEB9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3C3Q8NEB9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3C3Q8NEB9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3C3Q8NEB9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3C3Q8NEB9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3C3Q8NEB9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3C3Q8NEB9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3C3Q8NEB9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3C3Q8NEB9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3C3Q8NEB9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3C3Q8NEB9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3C3Q8NEB9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3C3Q8NEB9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3C3Q8NEB9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3C3Q8NEB9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3C3Q8NEB9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3C3Q8NEB9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3C3Q8NEB9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3C3Q8NEB9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3C3Q8NEB9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3C3Q8NEB9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3C3Q8NEB9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3C3Q8NEB9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3C3Q8NEB9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3C3Q8NEB9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PIK3C3Q8NEB9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIK3C3Q8NEB9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIK3C3Q8NEB9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIK3C3Q8NEB9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIK3C3Q8NEB9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIK3C3Q8NEB9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIK3C3Q8NEB9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIK3C3Q8NEB9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3C3Q8NEB9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3C3Q8NEB9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3C3Q8NEB9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3C3Q8NEB9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3C3Q8NEB9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3C3Q8NEB9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms