Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB12

SMYD1, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD1, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD1Q8NB12 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMYD1Q8NB12 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMYD1Q8NB12 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMYD1Q8NB12 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SMYD1Q8NB12 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SMYD1Q8NB12 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SMYD1Q8NB12 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SMYD1Q8NB12 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SMYD1Q8NB12 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SMYD1Q8NB12 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SMYD1Q8NB12 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SMYD1Q8NB12 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SMYD1Q8NB12 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMYD1Q8NB12 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SMYD1Q8NB12 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMYD1Q8NB12 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMYD1Q8NB12 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMYD1Q8NB12 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMYD1Q8NB12 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMYD1Q8NB12 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMYD1Q8NB12 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMYD1Q8NB12 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMYD1Q8NB12 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMYD1Q8NB12 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMYD1Q8NB12 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMYD1Q8NB12 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMYD1Q8NB12 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMYD1Q8NB12 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMYD1Q8NB12 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMYD1Q8NB12 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMYD1Q8NB12 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMYD1Q8NB12 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMYD1Q8NB12 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMYD1Q8NB12 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMYD1Q8NB12 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMYD1Q8NB12 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMYD1Q8NB12 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SMYD1Q8NB12 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMYD1Q8NB12 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMYD1Q8NB12 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMYD1Q8NB12 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMYD1Q8NB12 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMYD1Q8NB12 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMYD1Q8NB12 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMYD1Q8NB12 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMYD1Q8NB12 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMYD1Q8NB12 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMYD1Q8NB12 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMYD1Q8NB12 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMYD1Q8NB12 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMYD1Q8NB12 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMYD1Q8NB12 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SMYD1Q8NB12 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SMYD1Q8NB12 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SMYD1Q8NB12 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMYD1Q8NB12 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMYD1Q8NB12 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMYD1Q8NB12 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SMYD1Q8NB12 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SMYD1Q8NB12 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMYD1Q8NB12 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMYD1Q8NB12 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMYD1Q8NB12 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMYD1Q8NB12 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMYD1Q8NB12 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMYD1Q8NB12 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMYD1Q8NB12 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMYD1Q8NB12 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SMYD1Q8NB12 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMYD1Q8NB12 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SMYD1Q8NB12 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMYD1Q8NB12 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMYD1Q8NB12 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMYD1Q8NB12 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SMYD1Q8NB12 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMYD1Q8NB12 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMYD1Q8NB12 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMYD1Q8NB12 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMYD1Q8NB12 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMYD1Q8NB12 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMYD1Q8NB12 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMYD1Q8NB12 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMYD1Q8NB12 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMYD1Q8NB12 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMYD1Q8NB12 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMYD1Q8NB12 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMYD1Q8NB12 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMYD1Q8NB12 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMYD1Q8NB12 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMYD1Q8NB12 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMYD1Q8NB12 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMYD1Q8NB12 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMYD1Q8NB12 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMYD1Q8NB12 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMYD1Q8NB12 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMYD1Q8NB12 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMYD1Q8NB12 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMYD1Q8NB12 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMYD1Q8NB12 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMYD1Q8NB12 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms