Protein–RNA interactions for Protein: Q8N140

EID3, EP300-interacting inhibitor of differentiation 3, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EID3Q8N140 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EID3Q8N140 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EID3Q8N140 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EID3Q8N140 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EID3Q8N140 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EID3Q8N140 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EID3Q8N140 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
EID3Q8N140 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EID3Q8N140 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EID3Q8N140 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EID3Q8N140 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EID3Q8N140 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EID3Q8N140 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EID3Q8N140 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EID3Q8N140 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EID3Q8N140 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EID3Q8N140 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EID3Q8N140 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EID3Q8N140 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EID3Q8N140 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EID3Q8N140 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EID3Q8N140 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EID3Q8N140 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EID3Q8N140 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EID3Q8N140 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EID3Q8N140 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EID3Q8N140 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EID3Q8N140 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EID3Q8N140 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EID3Q8N140 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
EID3Q8N140 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EID3Q8N140 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EID3Q8N140 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EID3Q8N140 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EID3Q8N140 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EID3Q8N140 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EID3Q8N140 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EID3Q8N140 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EID3Q8N140 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EID3Q8N140 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EID3Q8N140 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EID3Q8N140 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EID3Q8N140 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EID3Q8N140 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EID3Q8N140 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EID3Q8N140 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EID3Q8N140 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EID3Q8N140 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EID3Q8N140 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EID3Q8N140 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EID3Q8N140 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EID3Q8N140 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EID3Q8N140 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
EID3Q8N140 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EID3Q8N140 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EID3Q8N140 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EID3Q8N140 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EID3Q8N140 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EID3Q8N140 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EID3Q8N140 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EID3Q8N140 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EID3Q8N140 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EID3Q8N140 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EID3Q8N140 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
EID3Q8N140 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EID3Q8N140 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EID3Q8N140 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EID3Q8N140 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EID3Q8N140 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EID3Q8N140 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EID3Q8N140 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EID3Q8N140 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
EID3Q8N140 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
EID3Q8N140 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EID3Q8N140 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EID3Q8N140 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EID3Q8N140 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EID3Q8N140 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EID3Q8N140 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EID3Q8N140 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EID3Q8N140 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EID3Q8N140 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EID3Q8N140 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EID3Q8N140 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
EID3Q8N140 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EID3Q8N140 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EID3Q8N140 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EID3Q8N140 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EID3Q8N140 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EID3Q8N140 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EID3Q8N140 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EID3Q8N140 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EID3Q8N140 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
EID3Q8N140 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EID3Q8N140 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EID3Q8N140 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EID3Q8N140 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EID3Q8N140 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EID3Q8N140 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EID3Q8N140 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms