Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI2

RHOT1, Mitochondrial Rho GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT1Q8IXI2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RHOT1Q8IXI2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RHOT1Q8IXI2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RHOT1Q8IXI2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RHOT1Q8IXI2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RHOT1Q8IXI2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RHOT1Q8IXI2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RHOT1Q8IXI2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RHOT1Q8IXI2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RHOT1Q8IXI2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RHOT1Q8IXI2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RHOT1Q8IXI2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RHOT1Q8IXI2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RHOT1Q8IXI2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RHOT1Q8IXI2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RHOT1Q8IXI2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RHOT1Q8IXI2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RHOT1Q8IXI2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RHOT1Q8IXI2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RHOT1Q8IXI2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RHOT1Q8IXI2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RHOT1Q8IXI2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RHOT1Q8IXI2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RHOT1Q8IXI2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RHOT1Q8IXI2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RHOT1Q8IXI2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RHOT1Q8IXI2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RHOT1Q8IXI2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RHOT1Q8IXI2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RHOT1Q8IXI2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RHOT1Q8IXI2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RHOT1Q8IXI2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RHOT1Q8IXI2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RHOT1Q8IXI2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RHOT1Q8IXI2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RHOT1Q8IXI2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RHOT1Q8IXI2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RHOT1Q8IXI2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RHOT1Q8IXI2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RHOT1Q8IXI2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RHOT1Q8IXI2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RHOT1Q8IXI2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RHOT1Q8IXI2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RHOT1Q8IXI2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RHOT1Q8IXI2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RHOT1Q8IXI2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RHOT1Q8IXI2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RHOT1Q8IXI2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RHOT1Q8IXI2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RHOT1Q8IXI2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RHOT1Q8IXI2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RHOT1Q8IXI2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RHOT1Q8IXI2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RHOT1Q8IXI2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RHOT1Q8IXI2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RHOT1Q8IXI2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RHOT1Q8IXI2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RHOT1Q8IXI2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RHOT1Q8IXI2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RHOT1Q8IXI2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RHOT1Q8IXI2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RHOT1Q8IXI2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RHOT1Q8IXI2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RHOT1Q8IXI2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RHOT1Q8IXI2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RHOT1Q8IXI2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RHOT1Q8IXI2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHOT1Q8IXI2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHOT1Q8IXI2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHOT1Q8IXI2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHOT1Q8IXI2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHOT1Q8IXI2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHOT1Q8IXI2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHOT1Q8IXI2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHOT1Q8IXI2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHOT1Q8IXI2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHOT1Q8IXI2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHOT1Q8IXI2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHOT1Q8IXI2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHOT1Q8IXI2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHOT1Q8IXI2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHOT1Q8IXI2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHOT1Q8IXI2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RHOT1Q8IXI2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RHOT1Q8IXI2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RHOT1Q8IXI2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RHOT1Q8IXI2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RHOT1Q8IXI2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RHOT1Q8IXI2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RHOT1Q8IXI2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RHOT1Q8IXI2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RHOT1Q8IXI2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RHOT1Q8IXI2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RHOT1Q8IXI2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RHOT1Q8IXI2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RHOT1Q8IXI2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RHOT1Q8IXI2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RHOT1Q8IXI2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RHOT1Q8IXI2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RHOT1Q8IXI2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms