Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWA5

SLC44A2, Choline transporter-like protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A2Q8IWA5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC44A2Q8IWA5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC44A2Q8IWA5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC44A2Q8IWA5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC44A2Q8IWA5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC44A2Q8IWA5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC44A2Q8IWA5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC44A2Q8IWA5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC44A2Q8IWA5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC44A2Q8IWA5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC44A2Q8IWA5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC44A2Q8IWA5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC44A2Q8IWA5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC44A2Q8IWA5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC44A2Q8IWA5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC44A2Q8IWA5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC44A2Q8IWA5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC44A2Q8IWA5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC44A2Q8IWA5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC44A2Q8IWA5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC44A2Q8IWA5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC44A2Q8IWA5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC44A2Q8IWA5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC44A2Q8IWA5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC44A2Q8IWA5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC44A2Q8IWA5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC44A2Q8IWA5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC44A2Q8IWA5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC44A2Q8IWA5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC44A2Q8IWA5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC44A2Q8IWA5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC44A2Q8IWA5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC44A2Q8IWA5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC44A2Q8IWA5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC44A2Q8IWA5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC44A2Q8IWA5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC44A2Q8IWA5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC44A2Q8IWA5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC44A2Q8IWA5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC44A2Q8IWA5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC44A2Q8IWA5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC44A2Q8IWA5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC44A2Q8IWA5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC44A2Q8IWA5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC44A2Q8IWA5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC44A2Q8IWA5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC44A2Q8IWA5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
SLC44A2Q8IWA5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC44A2Q8IWA5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC44A2Q8IWA5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC44A2Q8IWA5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC44A2Q8IWA5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC44A2Q8IWA5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC44A2Q8IWA5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC44A2Q8IWA5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC44A2Q8IWA5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC44A2Q8IWA5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC44A2Q8IWA5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC44A2Q8IWA5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC44A2Q8IWA5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC44A2Q8IWA5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC44A2Q8IWA5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC44A2Q8IWA5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC44A2Q8IWA5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC44A2Q8IWA5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC44A2Q8IWA5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC44A2Q8IWA5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC44A2Q8IWA5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC44A2Q8IWA5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC44A2Q8IWA5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC44A2Q8IWA5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC44A2Q8IWA5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC44A2Q8IWA5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC44A2Q8IWA5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC44A2Q8IWA5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC44A2Q8IWA5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC44A2Q8IWA5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC44A2Q8IWA5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC44A2Q8IWA5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC44A2Q8IWA5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC44A2Q8IWA5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC44A2Q8IWA5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC44A2Q8IWA5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC44A2Q8IWA5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC44A2Q8IWA5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC44A2Q8IWA5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC44A2Q8IWA5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC44A2Q8IWA5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC44A2Q8IWA5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC44A2Q8IWA5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC44A2Q8IWA5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC44A2Q8IWA5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC44A2Q8IWA5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC44A2Q8IWA5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC44A2Q8IWA5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC44A2Q8IWA5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC44A2Q8IWA5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC44A2Q8IWA5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC44A2Q8IWA5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC44A2Q8IWA5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms