Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVP5

FUNDC1, FUN14 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUNDC1Q8IVP5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FUNDC1Q8IVP5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FUNDC1Q8IVP5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FUNDC1Q8IVP5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FUNDC1Q8IVP5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FUNDC1Q8IVP5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FUNDC1Q8IVP5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FUNDC1Q8IVP5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FUNDC1Q8IVP5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FUNDC1Q8IVP5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FUNDC1Q8IVP5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FUNDC1Q8IVP5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FUNDC1Q8IVP5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FUNDC1Q8IVP5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FUNDC1Q8IVP5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FUNDC1Q8IVP5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FUNDC1Q8IVP5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FUNDC1Q8IVP5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FUNDC1Q8IVP5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FUNDC1Q8IVP5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FUNDC1Q8IVP5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FUNDC1Q8IVP5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FUNDC1Q8IVP5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FUNDC1Q8IVP5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FUNDC1Q8IVP5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FUNDC1Q8IVP5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FUNDC1Q8IVP5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FUNDC1Q8IVP5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FUNDC1Q8IVP5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FUNDC1Q8IVP5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FUNDC1Q8IVP5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FUNDC1Q8IVP5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FUNDC1Q8IVP5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FUNDC1Q8IVP5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FUNDC1Q8IVP5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FUNDC1Q8IVP5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FUNDC1Q8IVP5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FUNDC1Q8IVP5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FUNDC1Q8IVP5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FUNDC1Q8IVP5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FUNDC1Q8IVP5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FUNDC1Q8IVP5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FUNDC1Q8IVP5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FUNDC1Q8IVP5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FUNDC1Q8IVP5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FUNDC1Q8IVP5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FUNDC1Q8IVP5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FUNDC1Q8IVP5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FUNDC1Q8IVP5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FUNDC1Q8IVP5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FUNDC1Q8IVP5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FUNDC1Q8IVP5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FUNDC1Q8IVP5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FUNDC1Q8IVP5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FUNDC1Q8IVP5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FUNDC1Q8IVP5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FUNDC1Q8IVP5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FUNDC1Q8IVP5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FUNDC1Q8IVP5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FUNDC1Q8IVP5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FUNDC1Q8IVP5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FUNDC1Q8IVP5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FUNDC1Q8IVP5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FUNDC1Q8IVP5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FUNDC1Q8IVP5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FUNDC1Q8IVP5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FUNDC1Q8IVP5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FUNDC1Q8IVP5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FUNDC1Q8IVP5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FUNDC1Q8IVP5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FUNDC1Q8IVP5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FUNDC1Q8IVP5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FUNDC1Q8IVP5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FUNDC1Q8IVP5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FUNDC1Q8IVP5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FUNDC1Q8IVP5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FUNDC1Q8IVP5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FUNDC1Q8IVP5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FUNDC1Q8IVP5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
FUNDC1Q8IVP5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
FUNDC1Q8IVP5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FUNDC1Q8IVP5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FUNDC1Q8IVP5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FUNDC1Q8IVP5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FUNDC1Q8IVP5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FUNDC1Q8IVP5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FUNDC1Q8IVP5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FUNDC1Q8IVP5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FUNDC1Q8IVP5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FUNDC1Q8IVP5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FUNDC1Q8IVP5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FUNDC1Q8IVP5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FUNDC1Q8IVP5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FUNDC1Q8IVP5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FUNDC1Q8IVP5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FUNDC1Q8IVP5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FUNDC1Q8IVP5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FUNDC1Q8IVP5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FUNDC1Q8IVP5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FUNDC1Q8IVP5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.4 ms