Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL6

P3H3, Prolyl 3-hydroxylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H3Q8IVL6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
P3H3Q8IVL6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
P3H3Q8IVL6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
P3H3Q8IVL6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
P3H3Q8IVL6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
P3H3Q8IVL6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
P3H3Q8IVL6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
P3H3Q8IVL6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
P3H3Q8IVL6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
P3H3Q8IVL6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
P3H3Q8IVL6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
P3H3Q8IVL6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
P3H3Q8IVL6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
P3H3Q8IVL6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
P3H3Q8IVL6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
P3H3Q8IVL6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
P3H3Q8IVL6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC38.95■■■■□ 3.83
P3H3Q8IVL6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
P3H3Q8IVL6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
P3H3Q8IVL6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
P3H3Q8IVL6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
P3H3Q8IVL6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
P3H3Q8IVL6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC38.94■■■■□ 3.82
P3H3Q8IVL6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
P3H3Q8IVL6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC38.93■■■■□ 3.82
P3H3Q8IVL6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
P3H3Q8IVL6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
P3H3Q8IVL6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
P3H3Q8IVL6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
P3H3Q8IVL6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
P3H3Q8IVL6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
P3H3Q8IVL6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
P3H3Q8IVL6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
P3H3Q8IVL6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
P3H3Q8IVL6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
P3H3Q8IVL6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
P3H3Q8IVL6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.89■■■■□ 3.82
P3H3Q8IVL6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
P3H3Q8IVL6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC38.88■■■■□ 3.81
P3H3Q8IVL6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
P3H3Q8IVL6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
P3H3Q8IVL6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
P3H3Q8IVL6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.87■■■■□ 3.81
P3H3Q8IVL6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
P3H3Q8IVL6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
P3H3Q8IVL6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.87■■■■□ 3.81
P3H3Q8IVL6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
P3H3Q8IVL6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
P3H3Q8IVL6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC38.85■■■■□ 3.81
P3H3Q8IVL6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
P3H3Q8IVL6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.84■■■■□ 3.81
P3H3Q8IVL6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.84■■■■□ 3.81
P3H3Q8IVL6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
P3H3Q8IVL6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC38.84■■■■□ 3.81
P3H3Q8IVL6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC38.84■■■■□ 3.81
P3H3Q8IVL6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
P3H3Q8IVL6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
P3H3Q8IVL6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
P3H3Q8IVL6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC38.83■■■■□ 3.81
P3H3Q8IVL6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
P3H3Q8IVL6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
P3H3Q8IVL6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
P3H3Q8IVL6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
P3H3Q8IVL6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
P3H3Q8IVL6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC38.82■■■■□ 3.8
P3H3Q8IVL6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
P3H3Q8IVL6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
P3H3Q8IVL6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
P3H3Q8IVL6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.8■■■■□ 3.8
P3H3Q8IVL6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC38.8■■■■□ 3.8
P3H3Q8IVL6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
P3H3Q8IVL6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC38.8■■■■□ 3.8
P3H3Q8IVL6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
P3H3Q8IVL6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC38.8■■■■□ 3.8
P3H3Q8IVL6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
P3H3Q8IVL6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC38.79■■■■□ 3.8
P3H3Q8IVL6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
P3H3Q8IVL6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
P3H3Q8IVL6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
P3H3Q8IVL6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
P3H3Q8IVL6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
P3H3Q8IVL6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
P3H3Q8IVL6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
P3H3Q8IVL6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
P3H3Q8IVL6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC38.77■■■■□ 3.8
P3H3Q8IVL6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
P3H3Q8IVL6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.76■■■■□ 3.8
P3H3Q8IVL6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.76■■■■□ 3.8
P3H3Q8IVL6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.76■■■■□ 3.8
P3H3Q8IVL6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
P3H3Q8IVL6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
P3H3Q8IVL6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.75■■■■□ 3.79
P3H3Q8IVL6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
P3H3Q8IVL6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
P3H3Q8IVL6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
P3H3Q8IVL6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
P3H3Q8IVL6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
P3H3Q8IVL6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
P3H3Q8IVL6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
P3H3Q8IVL6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC38.73■■■■□ 3.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.6 ms