Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV77

CNGA4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA4Q8IV77 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CNGA4Q8IV77 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNGA4Q8IV77 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNGA4Q8IV77 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNGA4Q8IV77 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNGA4Q8IV77 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNGA4Q8IV77 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNGA4Q8IV77 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNGA4Q8IV77 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CNGA4Q8IV77 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNGA4Q8IV77 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNGA4Q8IV77 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNGA4Q8IV77 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CNGA4Q8IV77 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNGA4Q8IV77 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNGA4Q8IV77 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNGA4Q8IV77 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNGA4Q8IV77 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CNGA4Q8IV77 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNGA4Q8IV77 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNGA4Q8IV77 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNGA4Q8IV77 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNGA4Q8IV77 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNGA4Q8IV77 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNGA4Q8IV77 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNGA4Q8IV77 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNGA4Q8IV77 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNGA4Q8IV77 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNGA4Q8IV77 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNGA4Q8IV77 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNGA4Q8IV77 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNGA4Q8IV77 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CNGA4Q8IV77 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CNGA4Q8IV77 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CNGA4Q8IV77 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CNGA4Q8IV77 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CNGA4Q8IV77 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CNGA4Q8IV77 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CNGA4Q8IV77 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CNGA4Q8IV77 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CNGA4Q8IV77 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNGA4Q8IV77 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CNGA4Q8IV77 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CNGA4Q8IV77 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CNGA4Q8IV77 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CNGA4Q8IV77 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNGA4Q8IV77 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNGA4Q8IV77 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNGA4Q8IV77 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNGA4Q8IV77 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNGA4Q8IV77 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNGA4Q8IV77 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNGA4Q8IV77 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNGA4Q8IV77 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNGA4Q8IV77 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNGA4Q8IV77 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNGA4Q8IV77 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNGA4Q8IV77 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNGA4Q8IV77 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNGA4Q8IV77 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNGA4Q8IV77 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CNGA4Q8IV77 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNGA4Q8IV77 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNGA4Q8IV77 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNGA4Q8IV77 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CNGA4Q8IV77 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNGA4Q8IV77 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNGA4Q8IV77 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNGA4Q8IV77 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNGA4Q8IV77 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNGA4Q8IV77 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNGA4Q8IV77 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNGA4Q8IV77 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNGA4Q8IV77 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNGA4Q8IV77 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNGA4Q8IV77 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNGA4Q8IV77 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNGA4Q8IV77 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CNGA4Q8IV77 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNGA4Q8IV77 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNGA4Q8IV77 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CNGA4Q8IV77 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CNGA4Q8IV77 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CNGA4Q8IV77 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNGA4Q8IV77 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNGA4Q8IV77 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNGA4Q8IV77 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNGA4Q8IV77 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNGA4Q8IV77 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNGA4Q8IV77 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNGA4Q8IV77 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNGA4Q8IV77 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNGA4Q8IV77 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNGA4Q8IV77 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNGA4Q8IV77 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNGA4Q8IV77 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNGA4Q8IV77 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNGA4Q8IV77 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNGA4Q8IV77 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNGA4Q8IV77 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms