Protein–RNA interactions for Protein: Q86TU6

LINC00523, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00523, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00523Q86TU6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LINC00523Q86TU6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LINC00523Q86TU6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LINC00523Q86TU6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LINC00523Q86TU6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LINC00523Q86TU6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LINC00523Q86TU6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LINC00523Q86TU6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LINC00523Q86TU6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LINC00523Q86TU6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LINC00523Q86TU6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LINC00523Q86TU6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LINC00523Q86TU6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LINC00523Q86TU6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LINC00523Q86TU6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LINC00523Q86TU6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LINC00523Q86TU6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LINC00523Q86TU6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LINC00523Q86TU6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LINC00523Q86TU6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LINC00523Q86TU6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LINC00523Q86TU6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LINC00523Q86TU6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LINC00523Q86TU6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LINC00523Q86TU6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LINC00523Q86TU6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LINC00523Q86TU6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LINC00523Q86TU6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
LINC00523Q86TU6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LINC00523Q86TU6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LINC00523Q86TU6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LINC00523Q86TU6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LINC00523Q86TU6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LINC00523Q86TU6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LINC00523Q86TU6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC00523Q86TU6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC00523Q86TU6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC00523Q86TU6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC00523Q86TU6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC00523Q86TU6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC00523Q86TU6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC00523Q86TU6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC00523Q86TU6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC00523Q86TU6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC00523Q86TU6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LINC00523Q86TU6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LINC00523Q86TU6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LINC00523Q86TU6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LINC00523Q86TU6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LINC00523Q86TU6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LINC00523Q86TU6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LINC00523Q86TU6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LINC00523Q86TU6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LINC00523Q86TU6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LINC00523Q86TU6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LINC00523Q86TU6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LINC00523Q86TU6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LINC00523Q86TU6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LINC00523Q86TU6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LINC00523Q86TU6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LINC00523Q86TU6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LINC00523Q86TU6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LINC00523Q86TU6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LINC00523Q86TU6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LINC00523Q86TU6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LINC00523Q86TU6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LINC00523Q86TU6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LINC00523Q86TU6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LINC00523Q86TU6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LINC00523Q86TU6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LINC00523Q86TU6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LINC00523Q86TU6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LINC00523Q86TU6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LINC00523Q86TU6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC00523Q86TU6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC00523Q86TU6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC00523Q86TU6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC00523Q86TU6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LINC00523Q86TU6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LINC00523Q86TU6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LINC00523Q86TU6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LINC00523Q86TU6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LINC00523Q86TU6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LINC00523Q86TU6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LINC00523Q86TU6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LINC00523Q86TU6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LINC00523Q86TU6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINC00523Q86TU6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINC00523Q86TU6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINC00523Q86TU6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINC00523Q86TU6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINC00523Q86TU6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINC00523Q86TU6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINC00523Q86TU6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINC00523Q86TU6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LINC00523Q86TU6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LINC00523Q86TU6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LINC00523Q86TU6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LINC00523Q86TU6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LINC00523Q86TU6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms