Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT6

SSX6, Putative protein SSX6, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX6Q7RTT6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSX6Q7RTT6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSX6Q7RTT6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSX6Q7RTT6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSX6Q7RTT6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSX6Q7RTT6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSX6Q7RTT6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSX6Q7RTT6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSX6Q7RTT6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSX6Q7RTT6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSX6Q7RTT6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSX6Q7RTT6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSX6Q7RTT6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSX6Q7RTT6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSX6Q7RTT6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSX6Q7RTT6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSX6Q7RTT6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSX6Q7RTT6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSX6Q7RTT6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSX6Q7RTT6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSX6Q7RTT6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSX6Q7RTT6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SSX6Q7RTT6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SSX6Q7RTT6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SSX6Q7RTT6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SSX6Q7RTT6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SSX6Q7RTT6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SSX6Q7RTT6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SSX6Q7RTT6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SSX6Q7RTT6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SSX6Q7RTT6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSX6Q7RTT6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSX6Q7RTT6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSX6Q7RTT6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSX6Q7RTT6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSX6Q7RTT6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSX6Q7RTT6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSX6Q7RTT6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSX6Q7RTT6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSX6Q7RTT6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SSX6Q7RTT6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSX6Q7RTT6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSX6Q7RTT6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SSX6Q7RTT6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSX6Q7RTT6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SSX6Q7RTT6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSX6Q7RTT6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSX6Q7RTT6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSX6Q7RTT6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSX6Q7RTT6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSX6Q7RTT6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSX6Q7RTT6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSX6Q7RTT6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSX6Q7RTT6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSX6Q7RTT6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSX6Q7RTT6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSX6Q7RTT6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SSX6Q7RTT6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSX6Q7RTT6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSX6Q7RTT6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSX6Q7RTT6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSX6Q7RTT6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSX6Q7RTT6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SSX6Q7RTT6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSX6Q7RTT6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSX6Q7RTT6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSX6Q7RTT6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSX6Q7RTT6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSX6Q7RTT6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SSX6Q7RTT6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSX6Q7RTT6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSX6Q7RTT6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSX6Q7RTT6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSX6Q7RTT6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSX6Q7RTT6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSX6Q7RTT6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSX6Q7RTT6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSX6Q7RTT6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSX6Q7RTT6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SSX6Q7RTT6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSX6Q7RTT6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSX6Q7RTT6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSX6Q7RTT6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSX6Q7RTT6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSX6Q7RTT6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSX6Q7RTT6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSX6Q7RTT6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSX6Q7RTT6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SSX6Q7RTT6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSX6Q7RTT6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SSX6Q7RTT6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SSX6Q7RTT6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SSX6Q7RTT6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSX6Q7RTT6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSX6Q7RTT6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSX6Q7RTT6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSX6Q7RTT6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSX6Q7RTT6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSX6Q7RTT6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSX6Q7RTT6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms