Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
HECW1Q76N89 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC38.27■■■■□ 3.72
HECW1Q76N89 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
HECW1Q76N89 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
HECW1Q76N89 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
HECW1Q76N89 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC38.26■■■■□ 3.71
HECW1Q76N89 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
HECW1Q76N89 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
HECW1Q76N89 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
HECW1Q76N89 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC38.23■■■■□ 3.71
HECW1Q76N89 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC38.23■■■■□ 3.71
HECW1Q76N89 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
HECW1Q76N89 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
HECW1Q76N89 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
HECW1Q76N89 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
HECW1Q76N89 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
HECW1Q76N89 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
HECW1Q76N89 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
HECW1Q76N89 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
HECW1Q76N89 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
HECW1Q76N89 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC38.21■■■■□ 3.71
HECW1Q76N89 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
HECW1Q76N89 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
HECW1Q76N89 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
HECW1Q76N89 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
HECW1Q76N89 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
HECW1Q76N89 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC38.2■■■■□ 3.71
HECW1Q76N89 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
HECW1Q76N89 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.7
HECW1Q76N89 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC38.2■■■■□ 3.7
HECW1Q76N89 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.7
HECW1Q76N89 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC38.2■■■■□ 3.7
HECW1Q76N89 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.7
HECW1Q76N89 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
HECW1Q76N89 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
HECW1Q76N89 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
HECW1Q76N89 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
HECW1Q76N89 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
HECW1Q76N89 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
HECW1Q76N89 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.17■■■■□ 3.7
HECW1Q76N89 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
HECW1Q76N89 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
HECW1Q76N89 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
HECW1Q76N89 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
HECW1Q76N89 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
HECW1Q76N89 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
HECW1Q76N89 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
HECW1Q76N89 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
HECW1Q76N89 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
HECW1Q76N89 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
HECW1Q76N89 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
HECW1Q76N89 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC38.15■■■■□ 3.7
HECW1Q76N89 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
HECW1Q76N89 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
HECW1Q76N89 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
HECW1Q76N89 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
HECW1Q76N89 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
HECW1Q76N89 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
HECW1Q76N89 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
HECW1Q76N89 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
HECW1Q76N89 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC38.12■■■■□ 3.69
HECW1Q76N89 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
HECW1Q76N89 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
HECW1Q76N89 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
HECW1Q76N89 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC38.09■■■■□ 3.69
HECW1Q76N89 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC38.09■■■■□ 3.69
HECW1Q76N89 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
HECW1Q76N89 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC38.08■■■■□ 3.69
HECW1Q76N89 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
HECW1Q76N89 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
HECW1Q76N89 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
HECW1Q76N89 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
HECW1Q76N89 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
HECW1Q76N89 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.68
HECW1Q76N89 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.68
HECW1Q76N89 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.68
HECW1Q76N89 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
HECW1Q76N89 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
HECW1Q76N89 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
HECW1Q76N89 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
HECW1Q76N89 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
HECW1Q76N89 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
HECW1Q76N89 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
HECW1Q76N89 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
HECW1Q76N89 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
HECW1Q76N89 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
HECW1Q76N89 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
HECW1Q76N89 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
HECW1Q76N89 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
HECW1Q76N89 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
HECW1Q76N89 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
HECW1Q76N89 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
HECW1Q76N89 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
HECW1Q76N89 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC38.02■■■■□ 3.68
HECW1Q76N89 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
HECW1Q76N89 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
HECW1Q76N89 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
HECW1Q76N89 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
HECW1Q76N89 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
HECW1Q76N89 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms