Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMUB2Q71RG4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMUB2Q71RG4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMUB2Q71RG4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMUB2Q71RG4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMUB2Q71RG4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMUB2Q71RG4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMUB2Q71RG4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMUB2Q71RG4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMUB2Q71RG4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMUB2Q71RG4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMUB2Q71RG4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMUB2Q71RG4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMUB2Q71RG4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMUB2Q71RG4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMUB2Q71RG4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMUB2Q71RG4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMUB2Q71RG4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMUB2Q71RG4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMUB2Q71RG4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMUB2Q71RG4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMUB2Q71RG4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMUB2Q71RG4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMUB2Q71RG4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMUB2Q71RG4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMUB2Q71RG4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMUB2Q71RG4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMUB2Q71RG4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMUB2Q71RG4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMUB2Q71RG4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMUB2Q71RG4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMUB2Q71RG4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMUB2Q71RG4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMUB2Q71RG4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMUB2Q71RG4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMUB2Q71RG4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMUB2Q71RG4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TMUB2Q71RG4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMUB2Q71RG4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMUB2Q71RG4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
TMUB2Q71RG4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMUB2Q71RG4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMUB2Q71RG4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMUB2Q71RG4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMUB2Q71RG4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TMUB2Q71RG4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMUB2Q71RG4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMUB2Q71RG4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMUB2Q71RG4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMUB2Q71RG4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMUB2Q71RG4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMUB2Q71RG4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMUB2Q71RG4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMUB2Q71RG4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMUB2Q71RG4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMUB2Q71RG4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMUB2Q71RG4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMUB2Q71RG4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMUB2Q71RG4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMUB2Q71RG4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMUB2Q71RG4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMUB2Q71RG4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMUB2Q71RG4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMUB2Q71RG4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMUB2Q71RG4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMUB2Q71RG4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMUB2Q71RG4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMUB2Q71RG4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMUB2Q71RG4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMUB2Q71RG4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMUB2Q71RG4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMUB2Q71RG4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMUB2Q71RG4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMUB2Q71RG4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMUB2Q71RG4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMUB2Q71RG4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMUB2Q71RG4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMUB2Q71RG4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMUB2Q71RG4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMUB2Q71RG4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMUB2Q71RG4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMUB2Q71RG4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMUB2Q71RG4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMUB2Q71RG4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMUB2Q71RG4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMUB2Q71RG4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMUB2Q71RG4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMUB2Q71RG4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMUB2Q71RG4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMUB2Q71RG4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMUB2Q71RG4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMUB2Q71RG4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMUB2Q71RG4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMUB2Q71RG4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMUB2Q71RG4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMUB2Q71RG4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMUB2Q71RG4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMUB2Q71RG4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMUB2Q71RG4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMUB2Q71RG4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms