Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQR2

CFAP77, Cilia- and flagella-associated protein 77, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP77Q6ZQR2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP77Q6ZQR2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP77Q6ZQR2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP77Q6ZQR2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP77Q6ZQR2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP77Q6ZQR2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP77Q6ZQR2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP77Q6ZQR2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP77Q6ZQR2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP77Q6ZQR2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP77Q6ZQR2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP77Q6ZQR2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CFAP77Q6ZQR2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CFAP77Q6ZQR2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP77Q6ZQR2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP77Q6ZQR2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP77Q6ZQR2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP77Q6ZQR2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP77Q6ZQR2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP77Q6ZQR2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP77Q6ZQR2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP77Q6ZQR2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP77Q6ZQR2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP77Q6ZQR2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP77Q6ZQR2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP77Q6ZQR2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP77Q6ZQR2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP77Q6ZQR2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP77Q6ZQR2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP77Q6ZQR2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP77Q6ZQR2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP77Q6ZQR2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP77Q6ZQR2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP77Q6ZQR2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP77Q6ZQR2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP77Q6ZQR2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP77Q6ZQR2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP77Q6ZQR2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP77Q6ZQR2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP77Q6ZQR2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP77Q6ZQR2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP77Q6ZQR2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP77Q6ZQR2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP77Q6ZQR2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP77Q6ZQR2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP77Q6ZQR2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP77Q6ZQR2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP77Q6ZQR2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP77Q6ZQR2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP77Q6ZQR2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP77Q6ZQR2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP77Q6ZQR2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP77Q6ZQR2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP77Q6ZQR2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP77Q6ZQR2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP77Q6ZQR2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP77Q6ZQR2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP77Q6ZQR2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP77Q6ZQR2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP77Q6ZQR2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP77Q6ZQR2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP77Q6ZQR2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP77Q6ZQR2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP77Q6ZQR2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP77Q6ZQR2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP77Q6ZQR2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP77Q6ZQR2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP77Q6ZQR2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP77Q6ZQR2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP77Q6ZQR2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP77Q6ZQR2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP77Q6ZQR2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CFAP77Q6ZQR2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CFAP77Q6ZQR2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CFAP77Q6ZQR2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CFAP77Q6ZQR2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CFAP77Q6ZQR2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP77Q6ZQR2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP77Q6ZQR2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP77Q6ZQR2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP77Q6ZQR2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP77Q6ZQR2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP77Q6ZQR2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP77Q6ZQR2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP77Q6ZQR2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP77Q6ZQR2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP77Q6ZQR2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP77Q6ZQR2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP77Q6ZQR2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP77Q6ZQR2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP77Q6ZQR2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP77Q6ZQR2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP77Q6ZQR2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP77Q6ZQR2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP77Q6ZQR2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP77Q6ZQR2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP77Q6ZQR2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP77Q6ZQR2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP77Q6ZQR2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP77Q6ZQR2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms