Protein–RNA interactions for Protein: Q6VY07

PACS1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1Q6VY07 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PACS1Q6VY07 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PACS1Q6VY07 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PACS1Q6VY07 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PACS1Q6VY07 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PACS1Q6VY07 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PACS1Q6VY07 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PACS1Q6VY07 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PACS1Q6VY07 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PACS1Q6VY07 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PACS1Q6VY07 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PACS1Q6VY07 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PACS1Q6VY07 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PACS1Q6VY07 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PACS1Q6VY07 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PACS1Q6VY07 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PACS1Q6VY07 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PACS1Q6VY07 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PACS1Q6VY07 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PACS1Q6VY07 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PACS1Q6VY07 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PACS1Q6VY07 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PACS1Q6VY07 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PACS1Q6VY07 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PACS1Q6VY07 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PACS1Q6VY07 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PACS1Q6VY07 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PACS1Q6VY07 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PACS1Q6VY07 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PACS1Q6VY07 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PACS1Q6VY07 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PACS1Q6VY07 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PACS1Q6VY07 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PACS1Q6VY07 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PACS1Q6VY07 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PACS1Q6VY07 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PACS1Q6VY07 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PACS1Q6VY07 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PACS1Q6VY07 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PACS1Q6VY07 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PACS1Q6VY07 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PACS1Q6VY07 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PACS1Q6VY07 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PACS1Q6VY07 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PACS1Q6VY07 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PACS1Q6VY07 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PACS1Q6VY07 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PACS1Q6VY07 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PACS1Q6VY07 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PACS1Q6VY07 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PACS1Q6VY07 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PACS1Q6VY07 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PACS1Q6VY07 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PACS1Q6VY07 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PACS1Q6VY07 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PACS1Q6VY07 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PACS1Q6VY07 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PACS1Q6VY07 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PACS1Q6VY07 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PACS1Q6VY07 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PACS1Q6VY07 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PACS1Q6VY07 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PACS1Q6VY07 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PACS1Q6VY07 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PACS1Q6VY07 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PACS1Q6VY07 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PACS1Q6VY07 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PACS1Q6VY07 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PACS1Q6VY07 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PACS1Q6VY07 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PACS1Q6VY07 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PACS1Q6VY07 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PACS1Q6VY07 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PACS1Q6VY07 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PACS1Q6VY07 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PACS1Q6VY07 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PACS1Q6VY07 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PACS1Q6VY07 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PACS1Q6VY07 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PACS1Q6VY07 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PACS1Q6VY07 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PACS1Q6VY07 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PACS1Q6VY07 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PACS1Q6VY07 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PACS1Q6VY07 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PACS1Q6VY07 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PACS1Q6VY07 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PACS1Q6VY07 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PACS1Q6VY07 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PACS1Q6VY07 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PACS1Q6VY07 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PACS1Q6VY07 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PACS1Q6VY07 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PACS1Q6VY07 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PACS1Q6VY07 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PACS1Q6VY07 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PACS1Q6VY07 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PACS1Q6VY07 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PACS1Q6VY07 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PACS1Q6VY07 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms