Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMIGD1Q6UXZ0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMIGD1Q6UXZ0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMIGD1Q6UXZ0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMIGD1Q6UXZ0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMIGD1Q6UXZ0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMIGD1Q6UXZ0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMIGD1Q6UXZ0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TMIGD1Q6UXZ0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMIGD1Q6UXZ0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMIGD1Q6UXZ0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMIGD1Q6UXZ0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMIGD1Q6UXZ0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TMIGD1Q6UXZ0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMIGD1Q6UXZ0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TMIGD1Q6UXZ0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMIGD1Q6UXZ0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TMIGD1Q6UXZ0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMIGD1Q6UXZ0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMIGD1Q6UXZ0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMIGD1Q6UXZ0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMIGD1Q6UXZ0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMIGD1Q6UXZ0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMIGD1Q6UXZ0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMIGD1Q6UXZ0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMIGD1Q6UXZ0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMIGD1Q6UXZ0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMIGD1Q6UXZ0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMIGD1Q6UXZ0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMIGD1Q6UXZ0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMIGD1Q6UXZ0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TMIGD1Q6UXZ0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMIGD1Q6UXZ0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMIGD1Q6UXZ0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TMIGD1Q6UXZ0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMIGD1Q6UXZ0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMIGD1Q6UXZ0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMIGD1Q6UXZ0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMIGD1Q6UXZ0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMIGD1Q6UXZ0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMIGD1Q6UXZ0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMIGD1Q6UXZ0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMIGD1Q6UXZ0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMIGD1Q6UXZ0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMIGD1Q6UXZ0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMIGD1Q6UXZ0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMIGD1Q6UXZ0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMIGD1Q6UXZ0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TMIGD1Q6UXZ0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMIGD1Q6UXZ0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMIGD1Q6UXZ0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMIGD1Q6UXZ0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMIGD1Q6UXZ0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMIGD1Q6UXZ0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMIGD1Q6UXZ0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMIGD1Q6UXZ0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMIGD1Q6UXZ0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMIGD1Q6UXZ0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMIGD1Q6UXZ0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMIGD1Q6UXZ0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMIGD1Q6UXZ0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMIGD1Q6UXZ0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMIGD1Q6UXZ0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMIGD1Q6UXZ0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMIGD1Q6UXZ0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMIGD1Q6UXZ0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMIGD1Q6UXZ0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMIGD1Q6UXZ0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMIGD1Q6UXZ0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMIGD1Q6UXZ0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMIGD1Q6UXZ0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMIGD1Q6UXZ0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TMIGD1Q6UXZ0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMIGD1Q6UXZ0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TMIGD1Q6UXZ0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMIGD1Q6UXZ0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMIGD1Q6UXZ0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMIGD1Q6UXZ0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMIGD1Q6UXZ0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMIGD1Q6UXZ0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMIGD1Q6UXZ0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMIGD1Q6UXZ0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMIGD1Q6UXZ0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMIGD1Q6UXZ0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMIGD1Q6UXZ0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMIGD1Q6UXZ0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMIGD1Q6UXZ0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMIGD1Q6UXZ0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMIGD1Q6UXZ0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMIGD1Q6UXZ0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMIGD1Q6UXZ0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMIGD1Q6UXZ0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TMIGD1Q6UXZ0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMIGD1Q6UXZ0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMIGD1Q6UXZ0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMIGD1Q6UXZ0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMIGD1Q6UXZ0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMIGD1Q6UXZ0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMIGD1Q6UXZ0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms