Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWF3

SCIMP, SLP adapter and CSK-interacting membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCIMPQ6UWF3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCIMPQ6UWF3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCIMPQ6UWF3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCIMPQ6UWF3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCIMPQ6UWF3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCIMPQ6UWF3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCIMPQ6UWF3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCIMPQ6UWF3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCIMPQ6UWF3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCIMPQ6UWF3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCIMPQ6UWF3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCIMPQ6UWF3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCIMPQ6UWF3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCIMPQ6UWF3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCIMPQ6UWF3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCIMPQ6UWF3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCIMPQ6UWF3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCIMPQ6UWF3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCIMPQ6UWF3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCIMPQ6UWF3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SCIMPQ6UWF3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCIMPQ6UWF3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCIMPQ6UWF3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCIMPQ6UWF3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCIMPQ6UWF3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCIMPQ6UWF3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCIMPQ6UWF3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCIMPQ6UWF3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCIMPQ6UWF3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCIMPQ6UWF3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCIMPQ6UWF3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCIMPQ6UWF3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCIMPQ6UWF3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCIMPQ6UWF3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCIMPQ6UWF3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCIMPQ6UWF3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCIMPQ6UWF3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCIMPQ6UWF3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCIMPQ6UWF3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCIMPQ6UWF3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCIMPQ6UWF3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCIMPQ6UWF3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCIMPQ6UWF3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCIMPQ6UWF3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCIMPQ6UWF3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCIMPQ6UWF3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCIMPQ6UWF3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCIMPQ6UWF3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCIMPQ6UWF3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCIMPQ6UWF3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCIMPQ6UWF3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCIMPQ6UWF3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCIMPQ6UWF3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCIMPQ6UWF3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCIMPQ6UWF3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCIMPQ6UWF3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCIMPQ6UWF3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCIMPQ6UWF3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCIMPQ6UWF3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCIMPQ6UWF3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCIMPQ6UWF3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCIMPQ6UWF3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCIMPQ6UWF3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCIMPQ6UWF3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SCIMPQ6UWF3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCIMPQ6UWF3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCIMPQ6UWF3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCIMPQ6UWF3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCIMPQ6UWF3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCIMPQ6UWF3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCIMPQ6UWF3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCIMPQ6UWF3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCIMPQ6UWF3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCIMPQ6UWF3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCIMPQ6UWF3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCIMPQ6UWF3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCIMPQ6UWF3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCIMPQ6UWF3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCIMPQ6UWF3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCIMPQ6UWF3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCIMPQ6UWF3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCIMPQ6UWF3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SCIMPQ6UWF3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCIMPQ6UWF3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCIMPQ6UWF3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCIMPQ6UWF3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCIMPQ6UWF3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCIMPQ6UWF3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCIMPQ6UWF3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCIMPQ6UWF3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCIMPQ6UWF3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCIMPQ6UWF3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCIMPQ6UWF3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCIMPQ6UWF3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCIMPQ6UWF3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCIMPQ6UWF3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCIMPQ6UWF3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCIMPQ6UWF3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SCIMPQ6UWF3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCIMPQ6UWF3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms