Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATRAIDQ6UW56 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATRAIDQ6UW56 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATRAIDQ6UW56 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATRAIDQ6UW56 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATRAIDQ6UW56 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATRAIDQ6UW56 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATRAIDQ6UW56 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATRAIDQ6UW56 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ATRAIDQ6UW56 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATRAIDQ6UW56 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATRAIDQ6UW56 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATRAIDQ6UW56 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATRAIDQ6UW56 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATRAIDQ6UW56 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATRAIDQ6UW56 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATRAIDQ6UW56 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATRAIDQ6UW56 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATRAIDQ6UW56 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATRAIDQ6UW56 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATRAIDQ6UW56 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATRAIDQ6UW56 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATRAIDQ6UW56 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATRAIDQ6UW56 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATRAIDQ6UW56 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATRAIDQ6UW56 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATRAIDQ6UW56 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATRAIDQ6UW56 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATRAIDQ6UW56 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATRAIDQ6UW56 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATRAIDQ6UW56 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATRAIDQ6UW56 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATRAIDQ6UW56 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATRAIDQ6UW56 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATRAIDQ6UW56 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATRAIDQ6UW56 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ATRAIDQ6UW56 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATRAIDQ6UW56 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATRAIDQ6UW56 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATRAIDQ6UW56 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ATRAIDQ6UW56 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATRAIDQ6UW56 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATRAIDQ6UW56 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATRAIDQ6UW56 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATRAIDQ6UW56 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATRAIDQ6UW56 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATRAIDQ6UW56 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATRAIDQ6UW56 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATRAIDQ6UW56 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATRAIDQ6UW56 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATRAIDQ6UW56 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATRAIDQ6UW56 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATRAIDQ6UW56 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATRAIDQ6UW56 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ATRAIDQ6UW56 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATRAIDQ6UW56 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATRAIDQ6UW56 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ATRAIDQ6UW56 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATRAIDQ6UW56 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATRAIDQ6UW56 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATRAIDQ6UW56 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ATRAIDQ6UW56 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATRAIDQ6UW56 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATRAIDQ6UW56 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATRAIDQ6UW56 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATRAIDQ6UW56 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATRAIDQ6UW56 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATRAIDQ6UW56 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATRAIDQ6UW56 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATRAIDQ6UW56 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATRAIDQ6UW56 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATRAIDQ6UW56 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATRAIDQ6UW56 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATRAIDQ6UW56 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATRAIDQ6UW56 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATRAIDQ6UW56 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATRAIDQ6UW56 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATRAIDQ6UW56 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATRAIDQ6UW56 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATRAIDQ6UW56 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ATRAIDQ6UW56 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATRAIDQ6UW56 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATRAIDQ6UW56 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATRAIDQ6UW56 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATRAIDQ6UW56 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATRAIDQ6UW56 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATRAIDQ6UW56 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATRAIDQ6UW56 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATRAIDQ6UW56 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ATRAIDQ6UW56 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATRAIDQ6UW56 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATRAIDQ6UW56 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ATRAIDQ6UW56 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATRAIDQ6UW56 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ATRAIDQ6UW56 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATRAIDQ6UW56 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATRAIDQ6UW56 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATRAIDQ6UW56 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATRAIDQ6UW56 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ATRAIDQ6UW56 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms