Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW02

CYP20A1, Cytochrome P450 20A1, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP20A1Q6UW02 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYP20A1Q6UW02 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYP20A1Q6UW02 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYP20A1Q6UW02 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYP20A1Q6UW02 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYP20A1Q6UW02 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYP20A1Q6UW02 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYP20A1Q6UW02 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CYP20A1Q6UW02 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYP20A1Q6UW02 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYP20A1Q6UW02 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYP20A1Q6UW02 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYP20A1Q6UW02 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYP20A1Q6UW02 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYP20A1Q6UW02 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYP20A1Q6UW02 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYP20A1Q6UW02 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYP20A1Q6UW02 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYP20A1Q6UW02 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYP20A1Q6UW02 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYP20A1Q6UW02 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYP20A1Q6UW02 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYP20A1Q6UW02 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYP20A1Q6UW02 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYP20A1Q6UW02 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYP20A1Q6UW02 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYP20A1Q6UW02 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYP20A1Q6UW02 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CYP20A1Q6UW02 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CYP20A1Q6UW02 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP20A1Q6UW02 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP20A1Q6UW02 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP20A1Q6UW02 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP20A1Q6UW02 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYP20A1Q6UW02 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYP20A1Q6UW02 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYP20A1Q6UW02 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CYP20A1Q6UW02 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYP20A1Q6UW02 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYP20A1Q6UW02 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYP20A1Q6UW02 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP20A1Q6UW02 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP20A1Q6UW02 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP20A1Q6UW02 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP20A1Q6UW02 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP20A1Q6UW02 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP20A1Q6UW02 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP20A1Q6UW02 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP20A1Q6UW02 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP20A1Q6UW02 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP20A1Q6UW02 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP20A1Q6UW02 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP20A1Q6UW02 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP20A1Q6UW02 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP20A1Q6UW02 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP20A1Q6UW02 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP20A1Q6UW02 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP20A1Q6UW02 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP20A1Q6UW02 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP20A1Q6UW02 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP20A1Q6UW02 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP20A1Q6UW02 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP20A1Q6UW02 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP20A1Q6UW02 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP20A1Q6UW02 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP20A1Q6UW02 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP20A1Q6UW02 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP20A1Q6UW02 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP20A1Q6UW02 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP20A1Q6UW02 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP20A1Q6UW02 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP20A1Q6UW02 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP20A1Q6UW02 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP20A1Q6UW02 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP20A1Q6UW02 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP20A1Q6UW02 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP20A1Q6UW02 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP20A1Q6UW02 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP20A1Q6UW02 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP20A1Q6UW02 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP20A1Q6UW02 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP20A1Q6UW02 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP20A1Q6UW02 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP20A1Q6UW02 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP20A1Q6UW02 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP20A1Q6UW02 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP20A1Q6UW02 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP20A1Q6UW02 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP20A1Q6UW02 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP20A1Q6UW02 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYP20A1Q6UW02 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYP20A1Q6UW02 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYP20A1Q6UW02 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYP20A1Q6UW02 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYP20A1Q6UW02 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYP20A1Q6UW02 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYP20A1Q6UW02 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYP20A1Q6UW02 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYP20A1Q6UW02 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYP20A1Q6UW02 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms