Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBA3EQ6PEY2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBA3EQ6PEY2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBA3EQ6PEY2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBA3EQ6PEY2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBA3EQ6PEY2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBA3EQ6PEY2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBA3EQ6PEY2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBA3EQ6PEY2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBA3EQ6PEY2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBA3EQ6PEY2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBA3EQ6PEY2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBA3EQ6PEY2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBA3EQ6PEY2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBA3EQ6PEY2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBA3EQ6PEY2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBA3EQ6PEY2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBA3EQ6PEY2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBA3EQ6PEY2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBA3EQ6PEY2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBA3EQ6PEY2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBA3EQ6PEY2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBA3EQ6PEY2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBA3EQ6PEY2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBA3EQ6PEY2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBA3EQ6PEY2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBA3EQ6PEY2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBA3EQ6PEY2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBA3EQ6PEY2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBA3EQ6PEY2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBA3EQ6PEY2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBA3EQ6PEY2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBA3EQ6PEY2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBA3EQ6PEY2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBA3EQ6PEY2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBA3EQ6PEY2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBA3EQ6PEY2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBA3EQ6PEY2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBA3EQ6PEY2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBA3EQ6PEY2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBA3EQ6PEY2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBA3EQ6PEY2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBA3EQ6PEY2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBA3EQ6PEY2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBA3EQ6PEY2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBA3EQ6PEY2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBA3EQ6PEY2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBA3EQ6PEY2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBA3EQ6PEY2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBA3EQ6PEY2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBA3EQ6PEY2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBA3EQ6PEY2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBA3EQ6PEY2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBA3EQ6PEY2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBA3EQ6PEY2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBA3EQ6PEY2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBA3EQ6PEY2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBA3EQ6PEY2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBA3EQ6PEY2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBA3EQ6PEY2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBA3EQ6PEY2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBA3EQ6PEY2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBA3EQ6PEY2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBA3EQ6PEY2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBA3EQ6PEY2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBA3EQ6PEY2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBA3EQ6PEY2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBA3EQ6PEY2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBA3EQ6PEY2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBA3EQ6PEY2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBA3EQ6PEY2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBA3EQ6PEY2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBA3EQ6PEY2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBA3EQ6PEY2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBA3EQ6PEY2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBA3EQ6PEY2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBA3EQ6PEY2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBA3EQ6PEY2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBA3EQ6PEY2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBA3EQ6PEY2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBA3EQ6PEY2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBA3EQ6PEY2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBA3EQ6PEY2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBA3EQ6PEY2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBA3EQ6PEY2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBA3EQ6PEY2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBA3EQ6PEY2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBA3EQ6PEY2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBA3EQ6PEY2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBA3EQ6PEY2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBA3EQ6PEY2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TUBA3EQ6PEY2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBA3EQ6PEY2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBA3EQ6PEY2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBA3EQ6PEY2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBA3EQ6PEY2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBA3EQ6PEY2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBA3EQ6PEY2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBA3EQ6PEY2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBA3EQ6PEY2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.1 ms