Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB8

EMB, Embigin, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMBQ6PCB8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
EMBQ6PCB8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EMBQ6PCB8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EMBQ6PCB8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EMBQ6PCB8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EMBQ6PCB8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EMBQ6PCB8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EMBQ6PCB8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
EMBQ6PCB8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EMBQ6PCB8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EMBQ6PCB8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EMBQ6PCB8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
EMBQ6PCB8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EMBQ6PCB8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EMBQ6PCB8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EMBQ6PCB8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
EMBQ6PCB8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EMBQ6PCB8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EMBQ6PCB8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
EMBQ6PCB8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EMBQ6PCB8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EMBQ6PCB8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EMBQ6PCB8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EMBQ6PCB8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EMBQ6PCB8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EMBQ6PCB8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EMBQ6PCB8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EMBQ6PCB8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EMBQ6PCB8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EMBQ6PCB8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EMBQ6PCB8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EMBQ6PCB8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EMBQ6PCB8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EMBQ6PCB8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EMBQ6PCB8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EMBQ6PCB8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
EMBQ6PCB8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EMBQ6PCB8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EMBQ6PCB8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EMBQ6PCB8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EMBQ6PCB8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EMBQ6PCB8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EMBQ6PCB8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EMBQ6PCB8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EMBQ6PCB8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EMBQ6PCB8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
EMBQ6PCB8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EMBQ6PCB8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EMBQ6PCB8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
EMBQ6PCB8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EMBQ6PCB8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EMBQ6PCB8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EMBQ6PCB8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EMBQ6PCB8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EMBQ6PCB8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EMBQ6PCB8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EMBQ6PCB8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EMBQ6PCB8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EMBQ6PCB8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EMBQ6PCB8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EMBQ6PCB8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
EMBQ6PCB8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EMBQ6PCB8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EMBQ6PCB8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EMBQ6PCB8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EMBQ6PCB8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EMBQ6PCB8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EMBQ6PCB8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EMBQ6PCB8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EMBQ6PCB8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EMBQ6PCB8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EMBQ6PCB8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EMBQ6PCB8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EMBQ6PCB8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EMBQ6PCB8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EMBQ6PCB8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EMBQ6PCB8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EMBQ6PCB8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EMBQ6PCB8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EMBQ6PCB8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EMBQ6PCB8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EMBQ6PCB8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EMBQ6PCB8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EMBQ6PCB8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EMBQ6PCB8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EMBQ6PCB8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EMBQ6PCB8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
EMBQ6PCB8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EMBQ6PCB8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EMBQ6PCB8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EMBQ6PCB8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EMBQ6PCB8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EMBQ6PCB8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EMBQ6PCB8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EMBQ6PCB8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EMBQ6PCB8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EMBQ6PCB8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EMBQ6PCB8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EMBQ6PCB8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EMBQ6PCB8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms