Protein–RNA interactions for Protein: Q6B0I6

KDM4D, Lysine-specific demethylase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4DQ6B0I6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM4DQ6B0I6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM4DQ6B0I6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM4DQ6B0I6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM4DQ6B0I6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM4DQ6B0I6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM4DQ6B0I6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM4DQ6B0I6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM4DQ6B0I6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KDM4DQ6B0I6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KDM4DQ6B0I6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KDM4DQ6B0I6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KDM4DQ6B0I6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KDM4DQ6B0I6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM4DQ6B0I6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM4DQ6B0I6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM4DQ6B0I6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM4DQ6B0I6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM4DQ6B0I6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM4DQ6B0I6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM4DQ6B0I6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM4DQ6B0I6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM4DQ6B0I6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM4DQ6B0I6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM4DQ6B0I6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM4DQ6B0I6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM4DQ6B0I6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM4DQ6B0I6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM4DQ6B0I6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM4DQ6B0I6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM4DQ6B0I6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM4DQ6B0I6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM4DQ6B0I6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM4DQ6B0I6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM4DQ6B0I6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM4DQ6B0I6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM4DQ6B0I6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM4DQ6B0I6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM4DQ6B0I6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM4DQ6B0I6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM4DQ6B0I6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM4DQ6B0I6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM4DQ6B0I6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM4DQ6B0I6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM4DQ6B0I6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM4DQ6B0I6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM4DQ6B0I6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM4DQ6B0I6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM4DQ6B0I6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM4DQ6B0I6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM4DQ6B0I6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM4DQ6B0I6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM4DQ6B0I6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM4DQ6B0I6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM4DQ6B0I6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM4DQ6B0I6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM4DQ6B0I6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM4DQ6B0I6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM4DQ6B0I6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM4DQ6B0I6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM4DQ6B0I6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM4DQ6B0I6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM4DQ6B0I6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM4DQ6B0I6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KDM4DQ6B0I6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KDM4DQ6B0I6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM4DQ6B0I6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM4DQ6B0I6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM4DQ6B0I6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM4DQ6B0I6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM4DQ6B0I6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM4DQ6B0I6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM4DQ6B0I6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM4DQ6B0I6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM4DQ6B0I6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM4DQ6B0I6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM4DQ6B0I6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM4DQ6B0I6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM4DQ6B0I6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM4DQ6B0I6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM4DQ6B0I6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM4DQ6B0I6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM4DQ6B0I6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM4DQ6B0I6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM4DQ6B0I6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM4DQ6B0I6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM4DQ6B0I6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM4DQ6B0I6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM4DQ6B0I6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM4DQ6B0I6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM4DQ6B0I6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM4DQ6B0I6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDM4DQ6B0I6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDM4DQ6B0I6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDM4DQ6B0I6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDM4DQ6B0I6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDM4DQ6B0I6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDM4DQ6B0I6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDM4DQ6B0I6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM4DQ6B0I6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms