Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC9A4Q6AI14 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC9A4Q6AI14 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC9A4Q6AI14 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC9A4Q6AI14 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC9A4Q6AI14 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC9A4Q6AI14 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC9A4Q6AI14 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC9A4Q6AI14 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC9A4Q6AI14 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC9A4Q6AI14 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC9A4Q6AI14 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC9A4Q6AI14 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC9A4Q6AI14 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC9A4Q6AI14 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC9A4Q6AI14 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC9A4Q6AI14 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC9A4Q6AI14 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC9A4Q6AI14 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC9A4Q6AI14 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLC9A4Q6AI14 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC9A4Q6AI14 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC9A4Q6AI14 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC9A4Q6AI14 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC9A4Q6AI14 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC9A4Q6AI14 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC9A4Q6AI14 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC9A4Q6AI14 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC9A4Q6AI14 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC9A4Q6AI14 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC9A4Q6AI14 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC9A4Q6AI14 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC9A4Q6AI14 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC9A4Q6AI14 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC9A4Q6AI14 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC9A4Q6AI14 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC9A4Q6AI14 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC9A4Q6AI14 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC9A4Q6AI14 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC9A4Q6AI14 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC9A4Q6AI14 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC9A4Q6AI14 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC9A4Q6AI14 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC9A4Q6AI14 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC9A4Q6AI14 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC9A4Q6AI14 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC9A4Q6AI14 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC9A4Q6AI14 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC9A4Q6AI14 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC9A4Q6AI14 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC9A4Q6AI14 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC9A4Q6AI14 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC9A4Q6AI14 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC9A4Q6AI14 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC9A4Q6AI14 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC9A4Q6AI14 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC9A4Q6AI14 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC9A4Q6AI14 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC9A4Q6AI14 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC9A4Q6AI14 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC9A4Q6AI14 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC9A4Q6AI14 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC9A4Q6AI14 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC9A4Q6AI14 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC9A4Q6AI14 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC9A4Q6AI14 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC9A4Q6AI14 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC9A4Q6AI14 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC9A4Q6AI14 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC9A4Q6AI14 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC9A4Q6AI14 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC9A4Q6AI14 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC9A4Q6AI14 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC9A4Q6AI14 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC9A4Q6AI14 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC9A4Q6AI14 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC9A4Q6AI14 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC9A4Q6AI14 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC9A4Q6AI14 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC9A4Q6AI14 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC9A4Q6AI14 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC9A4Q6AI14 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC9A4Q6AI14 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC9A4Q6AI14 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC9A4Q6AI14 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC9A4Q6AI14 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC9A4Q6AI14 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC9A4Q6AI14 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC9A4Q6AI14 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC9A4Q6AI14 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC9A4Q6AI14 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC9A4Q6AI14 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC9A4Q6AI14 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC9A4Q6AI14 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC9A4Q6AI14 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC9A4Q6AI14 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC9A4Q6AI14 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC9A4Q6AI14 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC9A4Q6AI14 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC9A4Q6AI14 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms