Protein–RNA interactions for Protein: Q68D86

CCDC102B, Coiled-coil domain-containing protein 102B, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102BQ68D86 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC102BQ68D86 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC102BQ68D86 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC102BQ68D86 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC102BQ68D86 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC102BQ68D86 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC102BQ68D86 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC102BQ68D86 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC102BQ68D86 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC102BQ68D86 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC102BQ68D86 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC102BQ68D86 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC102BQ68D86 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC102BQ68D86 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC102BQ68D86 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC102BQ68D86 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC102BQ68D86 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC102BQ68D86 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC102BQ68D86 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC102BQ68D86 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC102BQ68D86 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC102BQ68D86 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC102BQ68D86 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC102BQ68D86 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC102BQ68D86 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC102BQ68D86 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC102BQ68D86 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC102BQ68D86 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC102BQ68D86 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC102BQ68D86 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC102BQ68D86 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC102BQ68D86 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC102BQ68D86 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC102BQ68D86 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC102BQ68D86 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC102BQ68D86 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC102BQ68D86 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC102BQ68D86 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC102BQ68D86 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC102BQ68D86 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC102BQ68D86 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC102BQ68D86 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC102BQ68D86 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC102BQ68D86 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC102BQ68D86 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC102BQ68D86 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC102BQ68D86 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC102BQ68D86 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC102BQ68D86 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC102BQ68D86 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC102BQ68D86 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC102BQ68D86 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC102BQ68D86 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC102BQ68D86 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CCDC102BQ68D86 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC102BQ68D86 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC102BQ68D86 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC102BQ68D86 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC102BQ68D86 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC102BQ68D86 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC102BQ68D86 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC102BQ68D86 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC102BQ68D86 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC102BQ68D86 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC102BQ68D86 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC102BQ68D86 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC102BQ68D86 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC102BQ68D86 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC102BQ68D86 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC102BQ68D86 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC102BQ68D86 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC102BQ68D86 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC102BQ68D86 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC102BQ68D86 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC102BQ68D86 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC102BQ68D86 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC102BQ68D86 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC102BQ68D86 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC102BQ68D86 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC102BQ68D86 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC102BQ68D86 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC102BQ68D86 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC102BQ68D86 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC102BQ68D86 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC102BQ68D86 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC102BQ68D86 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC102BQ68D86 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC102BQ68D86 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC102BQ68D86 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC102BQ68D86 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC102BQ68D86 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC102BQ68D86 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC102BQ68D86 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC102BQ68D86 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC102BQ68D86 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC102BQ68D86 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC102BQ68D86 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC102BQ68D86 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC102BQ68D86 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC102BQ68D86 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms