Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CREB3L3Q68CJ9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CREB3L3Q68CJ9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CREB3L3Q68CJ9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CREB3L3Q68CJ9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CREB3L3Q68CJ9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CREB3L3Q68CJ9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CREB3L3Q68CJ9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CREB3L3Q68CJ9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CREB3L3Q68CJ9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CREB3L3Q68CJ9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CREB3L3Q68CJ9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CREB3L3Q68CJ9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CREB3L3Q68CJ9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CREB3L3Q68CJ9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CREB3L3Q68CJ9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CREB3L3Q68CJ9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CREB3L3Q68CJ9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CREB3L3Q68CJ9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CREB3L3Q68CJ9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CREB3L3Q68CJ9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CREB3L3Q68CJ9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CREB3L3Q68CJ9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CREB3L3Q68CJ9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CREB3L3Q68CJ9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CREB3L3Q68CJ9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CREB3L3Q68CJ9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CREB3L3Q68CJ9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CREB3L3Q68CJ9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CREB3L3Q68CJ9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CREB3L3Q68CJ9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CREB3L3Q68CJ9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CREB3L3Q68CJ9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CREB3L3Q68CJ9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CREB3L3Q68CJ9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CREB3L3Q68CJ9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CREB3L3Q68CJ9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CREB3L3Q68CJ9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CREB3L3Q68CJ9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CREB3L3Q68CJ9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CREB3L3Q68CJ9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CREB3L3Q68CJ9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CREB3L3Q68CJ9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CREB3L3Q68CJ9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CREB3L3Q68CJ9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CREB3L3Q68CJ9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CREB3L3Q68CJ9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CREB3L3Q68CJ9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CREB3L3Q68CJ9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CREB3L3Q68CJ9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CREB3L3Q68CJ9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CREB3L3Q68CJ9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CREB3L3Q68CJ9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CREB3L3Q68CJ9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CREB3L3Q68CJ9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CREB3L3Q68CJ9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CREB3L3Q68CJ9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CREB3L3Q68CJ9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CREB3L3Q68CJ9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CREB3L3Q68CJ9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CREB3L3Q68CJ9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CREB3L3Q68CJ9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CREB3L3Q68CJ9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CREB3L3Q68CJ9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CREB3L3Q68CJ9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
CREB3L3Q68CJ9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CREB3L3Q68CJ9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CREB3L3Q68CJ9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CREB3L3Q68CJ9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CREB3L3Q68CJ9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CREB3L3Q68CJ9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CREB3L3Q68CJ9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CREB3L3Q68CJ9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CREB3L3Q68CJ9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CREB3L3Q68CJ9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CREB3L3Q68CJ9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CREB3L3Q68CJ9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CREB3L3Q68CJ9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CREB3L3Q68CJ9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CREB3L3Q68CJ9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CREB3L3Q68CJ9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CREB3L3Q68CJ9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CREB3L3Q68CJ9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CREB3L3Q68CJ9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CREB3L3Q68CJ9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CREB3L3Q68CJ9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CREB3L3Q68CJ9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CREB3L3Q68CJ9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CREB3L3Q68CJ9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CREB3L3Q68CJ9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CREB3L3Q68CJ9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CREB3L3Q68CJ9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CREB3L3Q68CJ9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CREB3L3Q68CJ9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CREB3L3Q68CJ9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CREB3L3Q68CJ9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CREB3L3Q68CJ9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CREB3L3Q68CJ9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CREB3L3Q68CJ9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CREB3L3Q68CJ9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms