Protein–RNA interactions for Protein: Q5YKI7

GGNBP1, Putative gametogenetin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGNBP1Q5YKI7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GGNBP1Q5YKI7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GGNBP1Q5YKI7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GGNBP1Q5YKI7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GGNBP1Q5YKI7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GGNBP1Q5YKI7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GGNBP1Q5YKI7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GGNBP1Q5YKI7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GGNBP1Q5YKI7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GGNBP1Q5YKI7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GGNBP1Q5YKI7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GGNBP1Q5YKI7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GGNBP1Q5YKI7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GGNBP1Q5YKI7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GGNBP1Q5YKI7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GGNBP1Q5YKI7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GGNBP1Q5YKI7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GGNBP1Q5YKI7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GGNBP1Q5YKI7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GGNBP1Q5YKI7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GGNBP1Q5YKI7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GGNBP1Q5YKI7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
GGNBP1Q5YKI7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GGNBP1Q5YKI7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GGNBP1Q5YKI7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GGNBP1Q5YKI7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GGNBP1Q5YKI7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GGNBP1Q5YKI7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GGNBP1Q5YKI7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GGNBP1Q5YKI7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GGNBP1Q5YKI7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GGNBP1Q5YKI7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GGNBP1Q5YKI7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GGNBP1Q5YKI7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GGNBP1Q5YKI7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GGNBP1Q5YKI7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GGNBP1Q5YKI7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
GGNBP1Q5YKI7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GGNBP1Q5YKI7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GGNBP1Q5YKI7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GGNBP1Q5YKI7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GGNBP1Q5YKI7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GGNBP1Q5YKI7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GGNBP1Q5YKI7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GGNBP1Q5YKI7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GGNBP1Q5YKI7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GGNBP1Q5YKI7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GGNBP1Q5YKI7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GGNBP1Q5YKI7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
GGNBP1Q5YKI7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
GGNBP1Q5YKI7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GGNBP1Q5YKI7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GGNBP1Q5YKI7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GGNBP1Q5YKI7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GGNBP1Q5YKI7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GGNBP1Q5YKI7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GGNBP1Q5YKI7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GGNBP1Q5YKI7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GGNBP1Q5YKI7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GGNBP1Q5YKI7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GGNBP1Q5YKI7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GGNBP1Q5YKI7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GGNBP1Q5YKI7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GGNBP1Q5YKI7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GGNBP1Q5YKI7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GGNBP1Q5YKI7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GGNBP1Q5YKI7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GGNBP1Q5YKI7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GGNBP1Q5YKI7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GGNBP1Q5YKI7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GGNBP1Q5YKI7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GGNBP1Q5YKI7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GGNBP1Q5YKI7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GGNBP1Q5YKI7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
GGNBP1Q5YKI7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GGNBP1Q5YKI7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GGNBP1Q5YKI7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GGNBP1Q5YKI7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GGNBP1Q5YKI7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GGNBP1Q5YKI7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GGNBP1Q5YKI7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GGNBP1Q5YKI7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GGNBP1Q5YKI7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GGNBP1Q5YKI7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GGNBP1Q5YKI7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GGNBP1Q5YKI7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
GGNBP1Q5YKI7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GGNBP1Q5YKI7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GGNBP1Q5YKI7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GGNBP1Q5YKI7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GGNBP1Q5YKI7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GGNBP1Q5YKI7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GGNBP1Q5YKI7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GGNBP1Q5YKI7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GGNBP1Q5YKI7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GGNBP1Q5YKI7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GGNBP1Q5YKI7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GGNBP1Q5YKI7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GGNBP1Q5YKI7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GGNBP1Q5YKI7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms