Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RNF20Q5VTR2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RNF20Q5VTR2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RNF20Q5VTR2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RNF20Q5VTR2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
RNF20Q5VTR2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
RNF20Q5VTR2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RNF20Q5VTR2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RNF20Q5VTR2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RNF20Q5VTR2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RNF20Q5VTR2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RNF20Q5VTR2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RNF20Q5VTR2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RNF20Q5VTR2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RNF20Q5VTR2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
RNF20Q5VTR2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RNF20Q5VTR2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RNF20Q5VTR2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RNF20Q5VTR2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RNF20Q5VTR2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RNF20Q5VTR2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RNF20Q5VTR2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RNF20Q5VTR2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RNF20Q5VTR2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RNF20Q5VTR2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RNF20Q5VTR2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RNF20Q5VTR2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RNF20Q5VTR2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RNF20Q5VTR2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RNF20Q5VTR2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RNF20Q5VTR2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RNF20Q5VTR2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RNF20Q5VTR2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RNF20Q5VTR2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RNF20Q5VTR2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RNF20Q5VTR2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RNF20Q5VTR2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RNF20Q5VTR2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RNF20Q5VTR2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RNF20Q5VTR2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RNF20Q5VTR2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RNF20Q5VTR2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RNF20Q5VTR2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RNF20Q5VTR2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
RNF20Q5VTR2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.2
RNF20Q5VTR2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RNF20Q5VTR2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RNF20Q5VTR2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RNF20Q5VTR2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RNF20Q5VTR2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RNF20Q5VTR2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RNF20Q5VTR2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RNF20Q5VTR2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RNF20Q5VTR2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RNF20Q5VTR2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RNF20Q5VTR2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RNF20Q5VTR2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RNF20Q5VTR2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RNF20Q5VTR2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RNF20Q5VTR2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RNF20Q5VTR2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RNF20Q5VTR2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RNF20Q5VTR2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RNF20Q5VTR2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RNF20Q5VTR2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RNF20Q5VTR2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RNF20Q5VTR2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RNF20Q5VTR2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
RNF20Q5VTR2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RNF20Q5VTR2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
RNF20Q5VTR2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RNF20Q5VTR2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RNF20Q5VTR2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RNF20Q5VTR2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RNF20Q5VTR2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
RNF20Q5VTR2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RNF20Q5VTR2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RNF20Q5VTR2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RNF20Q5VTR2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RNF20Q5VTR2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RNF20Q5VTR2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RNF20Q5VTR2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RNF20Q5VTR2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RNF20Q5VTR2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RNF20Q5VTR2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RNF20Q5VTR2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RNF20Q5VTR2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RNF20Q5VTR2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RNF20Q5VTR2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RNF20Q5VTR2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RNF20Q5VTR2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
RNF20Q5VTR2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RNF20Q5VTR2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RNF20Q5VTR2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RNF20Q5VTR2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
RNF20Q5VTR2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RNF20Q5VTR2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RNF20Q5VTR2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RNF20Q5VTR2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RNF20Q5VTR2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms