Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTJ3

KLHDC7A, Kelch domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC7AQ5VTJ3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLHDC7AQ5VTJ3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
KLHDC7AQ5VTJ3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLHDC7AQ5VTJ3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLHDC7AQ5VTJ3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLHDC7AQ5VTJ3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLHDC7AQ5VTJ3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHDC7AQ5VTJ3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHDC7AQ5VTJ3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHDC7AQ5VTJ3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHDC7AQ5VTJ3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHDC7AQ5VTJ3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHDC7AQ5VTJ3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHDC7AQ5VTJ3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHDC7AQ5VTJ3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHDC7AQ5VTJ3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHDC7AQ5VTJ3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHDC7AQ5VTJ3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHDC7AQ5VTJ3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHDC7AQ5VTJ3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHDC7AQ5VTJ3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHDC7AQ5VTJ3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHDC7AQ5VTJ3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHDC7AQ5VTJ3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KLHDC7AQ5VTJ3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KLHDC7AQ5VTJ3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KLHDC7AQ5VTJ3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KLHDC7AQ5VTJ3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KLHDC7AQ5VTJ3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
KLHDC7AQ5VTJ3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
KLHDC7AQ5VTJ3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
KLHDC7AQ5VTJ3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLHDC7AQ5VTJ3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLHDC7AQ5VTJ3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
KLHDC7AQ5VTJ3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHDC7AQ5VTJ3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHDC7AQ5VTJ3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHDC7AQ5VTJ3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHDC7AQ5VTJ3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHDC7AQ5VTJ3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHDC7AQ5VTJ3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLHDC7AQ5VTJ3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLHDC7AQ5VTJ3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
KLHDC7AQ5VTJ3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLHDC7AQ5VTJ3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLHDC7AQ5VTJ3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLHDC7AQ5VTJ3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLHDC7AQ5VTJ3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KLHDC7AQ5VTJ3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KLHDC7AQ5VTJ3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KLHDC7AQ5VTJ3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KLHDC7AQ5VTJ3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KLHDC7AQ5VTJ3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KLHDC7AQ5VTJ3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KLHDC7AQ5VTJ3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KLHDC7AQ5VTJ3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KLHDC7AQ5VTJ3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KLHDC7AQ5VTJ3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KLHDC7AQ5VTJ3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KLHDC7AQ5VTJ3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KLHDC7AQ5VTJ3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KLHDC7AQ5VTJ3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KLHDC7AQ5VTJ3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KLHDC7AQ5VTJ3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KLHDC7AQ5VTJ3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KLHDC7AQ5VTJ3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KLHDC7AQ5VTJ3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KLHDC7AQ5VTJ3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KLHDC7AQ5VTJ3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KLHDC7AQ5VTJ3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KLHDC7AQ5VTJ3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KLHDC7AQ5VTJ3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KLHDC7AQ5VTJ3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KLHDC7AQ5VTJ3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KLHDC7AQ5VTJ3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KLHDC7AQ5VTJ3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KLHDC7AQ5VTJ3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
KLHDC7AQ5VTJ3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KLHDC7AQ5VTJ3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KLHDC7AQ5VTJ3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KLHDC7AQ5VTJ3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KLHDC7AQ5VTJ3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KLHDC7AQ5VTJ3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KLHDC7AQ5VTJ3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KLHDC7AQ5VTJ3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KLHDC7AQ5VTJ3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KLHDC7AQ5VTJ3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KLHDC7AQ5VTJ3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KLHDC7AQ5VTJ3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KLHDC7AQ5VTJ3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KLHDC7AQ5VTJ3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KLHDC7AQ5VTJ3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KLHDC7AQ5VTJ3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KLHDC7AQ5VTJ3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KLHDC7AQ5VTJ3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KLHDC7AQ5VTJ3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KLHDC7AQ5VTJ3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KLHDC7AQ5VTJ3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KLHDC7AQ5VTJ3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KLHDC7AQ5VTJ3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms