Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC38Q5VT99 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC38Q5VT99 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC38Q5VT99 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC38Q5VT99 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC38Q5VT99 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC38Q5VT99 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC38Q5VT99 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC38Q5VT99 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC38Q5VT99 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC38Q5VT99 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC38Q5VT99 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC38Q5VT99 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC38Q5VT99 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC38Q5VT99 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC38Q5VT99 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC38Q5VT99 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC38Q5VT99 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC38Q5VT99 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRC38Q5VT99 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRC38Q5VT99 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRC38Q5VT99 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC38Q5VT99 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC38Q5VT99 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC38Q5VT99 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC38Q5VT99 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC38Q5VT99 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC38Q5VT99 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC38Q5VT99 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC38Q5VT99 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC38Q5VT99 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC38Q5VT99 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC38Q5VT99 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC38Q5VT99 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC38Q5VT99 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC38Q5VT99 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC38Q5VT99 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC38Q5VT99 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC38Q5VT99 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC38Q5VT99 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC38Q5VT99 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC38Q5VT99 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC38Q5VT99 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC38Q5VT99 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC38Q5VT99 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC38Q5VT99 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC38Q5VT99 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC38Q5VT99 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC38Q5VT99 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC38Q5VT99 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC38Q5VT99 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC38Q5VT99 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC38Q5VT99 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC38Q5VT99 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC38Q5VT99 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC38Q5VT99 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC38Q5VT99 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC38Q5VT99 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC38Q5VT99 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms