Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC38Q5VT99 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC38Q5VT99 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC38Q5VT99 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC38Q5VT99 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC38Q5VT99 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC38Q5VT99 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC38Q5VT99 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC38Q5VT99 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC38Q5VT99 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC38Q5VT99 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC38Q5VT99 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC38Q5VT99 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC38Q5VT99 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC38Q5VT99 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC38Q5VT99 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC38Q5VT99 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC38Q5VT99 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC38Q5VT99 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC38Q5VT99 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRC38Q5VT99 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRC38Q5VT99 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRC38Q5VT99 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC38Q5VT99 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC38Q5VT99 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC38Q5VT99 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC38Q5VT99 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC38Q5VT99 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC38Q5VT99 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC38Q5VT99 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC38Q5VT99 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC38Q5VT99 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC38Q5VT99 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC38Q5VT99 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC38Q5VT99 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC38Q5VT99 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC38Q5VT99 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC38Q5VT99 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC38Q5VT99 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC38Q5VT99 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC38Q5VT99 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC38Q5VT99 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC38Q5VT99 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC38Q5VT99 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC38Q5VT99 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC38Q5VT99 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC38Q5VT99 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC38Q5VT99 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC38Q5VT99 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC38Q5VT99 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC38Q5VT99 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC38Q5VT99 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC38Q5VT99 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC38Q5VT99 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC38Q5VT99 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC38Q5VT99 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC38Q5VT99 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC38Q5VT99 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC38Q5VT99 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC38Q5VT99 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
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