Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
STRIP1Q5VSL9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
STRIP1Q5VSL9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
STRIP1Q5VSL9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
STRIP1Q5VSL9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
STRIP1Q5VSL9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
STRIP1Q5VSL9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
STRIP1Q5VSL9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
STRIP1Q5VSL9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
STRIP1Q5VSL9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
STRIP1Q5VSL9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
STRIP1Q5VSL9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
STRIP1Q5VSL9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
STRIP1Q5VSL9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
STRIP1Q5VSL9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
STRIP1Q5VSL9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
STRIP1Q5VSL9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
STRIP1Q5VSL9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
STRIP1Q5VSL9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
STRIP1Q5VSL9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
STRIP1Q5VSL9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
STRIP1Q5VSL9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
STRIP1Q5VSL9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
STRIP1Q5VSL9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
STRIP1Q5VSL9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
STRIP1Q5VSL9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
STRIP1Q5VSL9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
STRIP1Q5VSL9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
STRIP1Q5VSL9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
STRIP1Q5VSL9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
STRIP1Q5VSL9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
STRIP1Q5VSL9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
STRIP1Q5VSL9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
STRIP1Q5VSL9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
STRIP1Q5VSL9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
STRIP1Q5VSL9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
STRIP1Q5VSL9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
STRIP1Q5VSL9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
STRIP1Q5VSL9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
STRIP1Q5VSL9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
STRIP1Q5VSL9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
STRIP1Q5VSL9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
STRIP1Q5VSL9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
STRIP1Q5VSL9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
STRIP1Q5VSL9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
STRIP1Q5VSL9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
STRIP1Q5VSL9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
STRIP1Q5VSL9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
STRIP1Q5VSL9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
STRIP1Q5VSL9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
STRIP1Q5VSL9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
STRIP1Q5VSL9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
STRIP1Q5VSL9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
STRIP1Q5VSL9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
STRIP1Q5VSL9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
STRIP1Q5VSL9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
STRIP1Q5VSL9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
STRIP1Q5VSL9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
STRIP1Q5VSL9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
STRIP1Q5VSL9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
STRIP1Q5VSL9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
STRIP1Q5VSL9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
STRIP1Q5VSL9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
STRIP1Q5VSL9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
STRIP1Q5VSL9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
STRIP1Q5VSL9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
STRIP1Q5VSL9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
STRIP1Q5VSL9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
STRIP1Q5VSL9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
STRIP1Q5VSL9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
STRIP1Q5VSL9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
STRIP1Q5VSL9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
STRIP1Q5VSL9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
STRIP1Q5VSL9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
STRIP1Q5VSL9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
STRIP1Q5VSL9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
STRIP1Q5VSL9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
STRIP1Q5VSL9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
STRIP1Q5VSL9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
STRIP1Q5VSL9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
STRIP1Q5VSL9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
STRIP1Q5VSL9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
STRIP1Q5VSL9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
STRIP1Q5VSL9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
STRIP1Q5VSL9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
STRIP1Q5VSL9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
STRIP1Q5VSL9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
STRIP1Q5VSL9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
STRIP1Q5VSL9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
STRIP1Q5VSL9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
STRIP1Q5VSL9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
STRIP1Q5VSL9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
STRIP1Q5VSL9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
STRIP1Q5VSL9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
STRIP1Q5VSL9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
STRIP1Q5VSL9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
STRIP1Q5VSL9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
STRIP1Q5VSL9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
STRIP1Q5VSL9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
STRIP1Q5VSL9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms