Protein–RNA interactions for Protein: Q5TC63

GRTP1, Growth hormone-regulated TBC protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRTP1Q5TC63 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRTP1Q5TC63 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRTP1Q5TC63 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRTP1Q5TC63 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRTP1Q5TC63 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRTP1Q5TC63 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRTP1Q5TC63 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRTP1Q5TC63 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRTP1Q5TC63 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRTP1Q5TC63 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRTP1Q5TC63 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRTP1Q5TC63 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRTP1Q5TC63 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRTP1Q5TC63 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRTP1Q5TC63 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRTP1Q5TC63 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRTP1Q5TC63 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRTP1Q5TC63 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRTP1Q5TC63 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GRTP1Q5TC63 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRTP1Q5TC63 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRTP1Q5TC63 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRTP1Q5TC63 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRTP1Q5TC63 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRTP1Q5TC63 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRTP1Q5TC63 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRTP1Q5TC63 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRTP1Q5TC63 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GRTP1Q5TC63 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GRTP1Q5TC63 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRTP1Q5TC63 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRTP1Q5TC63 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRTP1Q5TC63 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRTP1Q5TC63 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRTP1Q5TC63 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRTP1Q5TC63 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRTP1Q5TC63 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRTP1Q5TC63 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRTP1Q5TC63 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRTP1Q5TC63 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRTP1Q5TC63 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRTP1Q5TC63 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRTP1Q5TC63 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRTP1Q5TC63 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRTP1Q5TC63 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRTP1Q5TC63 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRTP1Q5TC63 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GRTP1Q5TC63 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRTP1Q5TC63 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRTP1Q5TC63 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRTP1Q5TC63 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRTP1Q5TC63 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GRTP1Q5TC63 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRTP1Q5TC63 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRTP1Q5TC63 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRTP1Q5TC63 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRTP1Q5TC63 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRTP1Q5TC63 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRTP1Q5TC63 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRTP1Q5TC63 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GRTP1Q5TC63 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRTP1Q5TC63 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRTP1Q5TC63 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRTP1Q5TC63 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRTP1Q5TC63 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRTP1Q5TC63 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRTP1Q5TC63 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRTP1Q5TC63 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRTP1Q5TC63 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRTP1Q5TC63 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRTP1Q5TC63 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GRTP1Q5TC63 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GRTP1Q5TC63 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRTP1Q5TC63 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRTP1Q5TC63 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRTP1Q5TC63 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRTP1Q5TC63 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRTP1Q5TC63 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRTP1Q5TC63 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRTP1Q5TC63 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRTP1Q5TC63 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRTP1Q5TC63 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRTP1Q5TC63 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRTP1Q5TC63 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRTP1Q5TC63 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRTP1Q5TC63 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GRTP1Q5TC63 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRTP1Q5TC63 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRTP1Q5TC63 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRTP1Q5TC63 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRTP1Q5TC63 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRTP1Q5TC63 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRTP1Q5TC63 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRTP1Q5TC63 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GRTP1Q5TC63 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRTP1Q5TC63 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRTP1Q5TC63 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRTP1Q5TC63 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GRTP1Q5TC63 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRTP1Q5TC63 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms