Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV17

TMEM240, Transmembrane protein 240, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM240Q5SV17 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMEM240Q5SV17 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMEM240Q5SV17 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMEM240Q5SV17 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMEM240Q5SV17 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM240Q5SV17 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM240Q5SV17 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM240Q5SV17 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM240Q5SV17 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM240Q5SV17 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM240Q5SV17 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM240Q5SV17 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM240Q5SV17 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM240Q5SV17 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM240Q5SV17 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM240Q5SV17 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM240Q5SV17 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM240Q5SV17 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM240Q5SV17 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMEM240Q5SV17 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMEM240Q5SV17 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMEM240Q5SV17 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TMEM240Q5SV17 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMEM240Q5SV17 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMEM240Q5SV17 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMEM240Q5SV17 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM240Q5SV17 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM240Q5SV17 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM240Q5SV17 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM240Q5SV17 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMEM240Q5SV17 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMEM240Q5SV17 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMEM240Q5SV17 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMEM240Q5SV17 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TMEM240Q5SV17 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMEM240Q5SV17 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
TMEM240Q5SV17 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMEM240Q5SV17 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMEM240Q5SV17 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMEM240Q5SV17 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMEM240Q5SV17 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM240Q5SV17 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM240Q5SV17 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM240Q5SV17 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM240Q5SV17 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM240Q5SV17 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM240Q5SV17 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM240Q5SV17 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM240Q5SV17 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM240Q5SV17 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM240Q5SV17 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM240Q5SV17 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM240Q5SV17 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM240Q5SV17 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM240Q5SV17 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM240Q5SV17 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM240Q5SV17 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM240Q5SV17 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM240Q5SV17 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM240Q5SV17 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM240Q5SV17 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM240Q5SV17 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM240Q5SV17 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM240Q5SV17 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM240Q5SV17 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM240Q5SV17 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM240Q5SV17 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM240Q5SV17 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM240Q5SV17 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM240Q5SV17 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM240Q5SV17 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM240Q5SV17 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM240Q5SV17 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM240Q5SV17 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM240Q5SV17 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM240Q5SV17 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM240Q5SV17 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM240Q5SV17 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM240Q5SV17 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM240Q5SV17 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM240Q5SV17 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM240Q5SV17 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM240Q5SV17 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM240Q5SV17 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMEM240Q5SV17 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMEM240Q5SV17 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMEM240Q5SV17 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMEM240Q5SV17 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMEM240Q5SV17 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMEM240Q5SV17 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMEM240Q5SV17 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TMEM240Q5SV17 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM240Q5SV17 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM240Q5SV17 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM240Q5SV17 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM240Q5SV17 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM240Q5SV17 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM240Q5SV17 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM240Q5SV17 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM240Q5SV17 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms