Protein–RNA interactions for Protein: Q5MAI5

CDKL4, Cyclin-dependent kinase-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL4Q5MAI5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CDKL4Q5MAI5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDKL4Q5MAI5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDKL4Q5MAI5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDKL4Q5MAI5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDKL4Q5MAI5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDKL4Q5MAI5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDKL4Q5MAI5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDKL4Q5MAI5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDKL4Q5MAI5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDKL4Q5MAI5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDKL4Q5MAI5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDKL4Q5MAI5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDKL4Q5MAI5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDKL4Q5MAI5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDKL4Q5MAI5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDKL4Q5MAI5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDKL4Q5MAI5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDKL4Q5MAI5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDKL4Q5MAI5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDKL4Q5MAI5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDKL4Q5MAI5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDKL4Q5MAI5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDKL4Q5MAI5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDKL4Q5MAI5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDKL4Q5MAI5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDKL4Q5MAI5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDKL4Q5MAI5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDKL4Q5MAI5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CDKL4Q5MAI5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDKL4Q5MAI5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKL4Q5MAI5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKL4Q5MAI5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKL4Q5MAI5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKL4Q5MAI5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKL4Q5MAI5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKL4Q5MAI5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKL4Q5MAI5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKL4Q5MAI5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKL4Q5MAI5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKL4Q5MAI5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKL4Q5MAI5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKL4Q5MAI5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKL4Q5MAI5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKL4Q5MAI5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKL4Q5MAI5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKL4Q5MAI5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDKL4Q5MAI5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDKL4Q5MAI5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDKL4Q5MAI5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDKL4Q5MAI5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDKL4Q5MAI5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDKL4Q5MAI5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDKL4Q5MAI5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDKL4Q5MAI5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDKL4Q5MAI5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDKL4Q5MAI5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDKL4Q5MAI5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDKL4Q5MAI5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKL4Q5MAI5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKL4Q5MAI5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKL4Q5MAI5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKL4Q5MAI5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKL4Q5MAI5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKL4Q5MAI5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKL4Q5MAI5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKL4Q5MAI5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKL4Q5MAI5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKL4Q5MAI5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKL4Q5MAI5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKL4Q5MAI5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKL4Q5MAI5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKL4Q5MAI5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKL4Q5MAI5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKL4Q5MAI5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKL4Q5MAI5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKL4Q5MAI5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKL4Q5MAI5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKL4Q5MAI5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKL4Q5MAI5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKL4Q5MAI5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKL4Q5MAI5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKL4Q5MAI5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKL4Q5MAI5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDKL4Q5MAI5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDKL4Q5MAI5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDKL4Q5MAI5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDKL4Q5MAI5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDKL4Q5MAI5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDKL4Q5MAI5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDKL4Q5MAI5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CDKL4Q5MAI5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CDKL4Q5MAI5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDKL4Q5MAI5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDKL4Q5MAI5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDKL4Q5MAI5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDKL4Q5MAI5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDKL4Q5MAI5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDKL4Q5MAI5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDKL4Q5MAI5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.9 ms