Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
SLC27A3Q5K4L6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
SLC27A3Q5K4L6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
SLC27A3Q5K4L6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
SLC27A3Q5K4L6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SLC27A3Q5K4L6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SLC27A3Q5K4L6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SLC27A3Q5K4L6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SLC27A3Q5K4L6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
SLC27A3Q5K4L6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
SLC27A3Q5K4L6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SLC27A3Q5K4L6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SLC27A3Q5K4L6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SLC27A3Q5K4L6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
SLC27A3Q5K4L6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
SLC27A3Q5K4L6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
SLC27A3Q5K4L6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
SLC27A3Q5K4L6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
SLC27A3Q5K4L6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
SLC27A3Q5K4L6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SLC27A3Q5K4L6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SLC27A3Q5K4L6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SLC27A3Q5K4L6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SLC27A3Q5K4L6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SLC27A3Q5K4L6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SLC27A3Q5K4L6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SLC27A3Q5K4L6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SLC27A3Q5K4L6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SLC27A3Q5K4L6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
SLC27A3Q5K4L6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC31.39■■■□□ 2.62
SLC27A3Q5K4L6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
SLC27A3Q5K4L6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
SLC27A3Q5K4L6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
SLC27A3Q5K4L6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SLC27A3Q5K4L6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SLC27A3Q5K4L6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SLC27A3Q5K4L6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SLC27A3Q5K4L6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SLC27A3Q5K4L6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SLC27A3Q5K4L6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
SLC27A3Q5K4L6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
SLC27A3Q5K4L6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SLC27A3Q5K4L6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SLC27A3Q5K4L6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SLC27A3Q5K4L6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC31.35■■■□□ 2.61
SLC27A3Q5K4L6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
SLC27A3Q5K4L6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
SLC27A3Q5K4L6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SLC27A3Q5K4L6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SLC27A3Q5K4L6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
SLC27A3Q5K4L6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SLC27A3Q5K4L6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
SLC27A3Q5K4L6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SLC27A3Q5K4L6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SLC27A3Q5K4L6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SLC27A3Q5K4L6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SLC27A3Q5K4L6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SLC27A3Q5K4L6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
SLC27A3Q5K4L6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
SLC27A3Q5K4L6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
SLC27A3Q5K4L6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
SLC27A3Q5K4L6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
SLC27A3Q5K4L6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SLC27A3Q5K4L6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC31.31■■■□□ 2.6
SLC27A3Q5K4L6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
SLC27A3Q5K4L6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
SLC27A3Q5K4L6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
SLC27A3Q5K4L6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
SLC27A3Q5K4L6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SLC27A3Q5K4L6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SLC27A3Q5K4L6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SLC27A3Q5K4L6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
SLC27A3Q5K4L6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
SLC27A3Q5K4L6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
SLC27A3Q5K4L6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
SLC27A3Q5K4L6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
SLC27A3Q5K4L6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
SLC27A3Q5K4L6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SLC27A3Q5K4L6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
SLC27A3Q5K4L6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
SLC27A3Q5K4L6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
SLC27A3Q5K4L6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.59
SLC27A3Q5K4L6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SLC27A3Q5K4L6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SLC27A3Q5K4L6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SLC27A3Q5K4L6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SLC27A3Q5K4L6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SLC27A3Q5K4L6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SLC27A3Q5K4L6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
SLC27A3Q5K4L6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SLC27A3Q5K4L6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SLC27A3Q5K4L6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SLC27A3Q5K4L6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SLC27A3Q5K4L6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SLC27A3Q5K4L6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SLC27A3Q5K4L6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SLC27A3Q5K4L6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SLC27A3Q5K4L6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SLC27A3Q5K4L6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SLC27A3Q5K4L6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
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