Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVS0

HABP4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HABP4Q5JVS0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HABP4Q5JVS0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
HABP4Q5JVS0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HABP4Q5JVS0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HABP4Q5JVS0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HABP4Q5JVS0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HABP4Q5JVS0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HABP4Q5JVS0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HABP4Q5JVS0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HABP4Q5JVS0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HABP4Q5JVS0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HABP4Q5JVS0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HABP4Q5JVS0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HABP4Q5JVS0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HABP4Q5JVS0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HABP4Q5JVS0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HABP4Q5JVS0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HABP4Q5JVS0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HABP4Q5JVS0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HABP4Q5JVS0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HABP4Q5JVS0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HABP4Q5JVS0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HABP4Q5JVS0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HABP4Q5JVS0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HABP4Q5JVS0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HABP4Q5JVS0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HABP4Q5JVS0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HABP4Q5JVS0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HABP4Q5JVS0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HABP4Q5JVS0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HABP4Q5JVS0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HABP4Q5JVS0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HABP4Q5JVS0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HABP4Q5JVS0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HABP4Q5JVS0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
HABP4Q5JVS0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
HABP4Q5JVS0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
HABP4Q5JVS0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
HABP4Q5JVS0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HABP4Q5JVS0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HABP4Q5JVS0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HABP4Q5JVS0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HABP4Q5JVS0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
HABP4Q5JVS0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HABP4Q5JVS0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HABP4Q5JVS0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HABP4Q5JVS0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HABP4Q5JVS0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HABP4Q5JVS0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HABP4Q5JVS0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HABP4Q5JVS0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HABP4Q5JVS0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HABP4Q5JVS0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HABP4Q5JVS0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
HABP4Q5JVS0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
HABP4Q5JVS0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HABP4Q5JVS0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HABP4Q5JVS0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HABP4Q5JVS0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
HABP4Q5JVS0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HABP4Q5JVS0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HABP4Q5JVS0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HABP4Q5JVS0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HABP4Q5JVS0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HABP4Q5JVS0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HABP4Q5JVS0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HABP4Q5JVS0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HABP4Q5JVS0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HABP4Q5JVS0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HABP4Q5JVS0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HABP4Q5JVS0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HABP4Q5JVS0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
HABP4Q5JVS0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
HABP4Q5JVS0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HABP4Q5JVS0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
HABP4Q5JVS0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HABP4Q5JVS0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HABP4Q5JVS0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HABP4Q5JVS0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HABP4Q5JVS0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HABP4Q5JVS0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HABP4Q5JVS0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HABP4Q5JVS0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HABP4Q5JVS0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HABP4Q5JVS0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HABP4Q5JVS0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
HABP4Q5JVS0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HABP4Q5JVS0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HABP4Q5JVS0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HABP4Q5JVS0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HABP4Q5JVS0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HABP4Q5JVS0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HABP4Q5JVS0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HABP4Q5JVS0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HABP4Q5JVS0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HABP4Q5JVS0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
HABP4Q5JVS0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HABP4Q5JVS0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
HABP4Q5JVS0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HABP4Q5JVS0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms