Protein–RNA interactions for Protein: Q5JQF7

LINC01556, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01556, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01556Q5JQF7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01556Q5JQF7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01556Q5JQF7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01556Q5JQF7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01556Q5JQF7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01556Q5JQF7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01556Q5JQF7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01556Q5JQF7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
LINC01556Q5JQF7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LINC01556Q5JQF7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01556Q5JQF7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01556Q5JQF7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01556Q5JQF7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01556Q5JQF7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01556Q5JQF7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01556Q5JQF7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01556Q5JQF7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01556Q5JQF7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01556Q5JQF7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01556Q5JQF7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01556Q5JQF7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01556Q5JQF7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01556Q5JQF7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01556Q5JQF7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01556Q5JQF7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01556Q5JQF7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01556Q5JQF7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01556Q5JQF7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01556Q5JQF7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01556Q5JQF7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01556Q5JQF7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01556Q5JQF7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01556Q5JQF7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01556Q5JQF7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01556Q5JQF7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01556Q5JQF7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01556Q5JQF7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01556Q5JQF7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01556Q5JQF7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01556Q5JQF7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01556Q5JQF7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01556Q5JQF7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01556Q5JQF7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01556Q5JQF7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01556Q5JQF7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01556Q5JQF7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01556Q5JQF7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01556Q5JQF7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01556Q5JQF7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01556Q5JQF7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01556Q5JQF7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01556Q5JQF7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01556Q5JQF7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01556Q5JQF7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01556Q5JQF7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01556Q5JQF7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01556Q5JQF7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01556Q5JQF7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01556Q5JQF7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01556Q5JQF7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01556Q5JQF7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01556Q5JQF7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01556Q5JQF7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01556Q5JQF7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01556Q5JQF7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01556Q5JQF7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01556Q5JQF7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01556Q5JQF7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01556Q5JQF7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01556Q5JQF7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01556Q5JQF7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01556Q5JQF7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01556Q5JQF7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01556Q5JQF7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01556Q5JQF7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01556Q5JQF7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01556Q5JQF7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01556Q5JQF7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01556Q5JQF7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01556Q5JQF7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01556Q5JQF7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01556Q5JQF7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01556Q5JQF7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01556Q5JQF7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01556Q5JQF7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01556Q5JQF7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01556Q5JQF7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01556Q5JQF7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01556Q5JQF7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01556Q5JQF7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01556Q5JQF7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01556Q5JQF7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01556Q5JQF7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01556Q5JQF7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01556Q5JQF7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01556Q5JQF7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01556Q5JQF7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01556Q5JQF7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01556Q5JQF7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01556Q5JQF7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms