Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC9

EIPR1, EARP-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIPR1Q53HC9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIPR1Q53HC9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIPR1Q53HC9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIPR1Q53HC9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIPR1Q53HC9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIPR1Q53HC9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIPR1Q53HC9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIPR1Q53HC9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIPR1Q53HC9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIPR1Q53HC9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIPR1Q53HC9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIPR1Q53HC9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIPR1Q53HC9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIPR1Q53HC9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIPR1Q53HC9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIPR1Q53HC9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIPR1Q53HC9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIPR1Q53HC9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIPR1Q53HC9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIPR1Q53HC9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIPR1Q53HC9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIPR1Q53HC9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIPR1Q53HC9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
EIPR1Q53HC9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIPR1Q53HC9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIPR1Q53HC9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIPR1Q53HC9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIPR1Q53HC9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EIPR1Q53HC9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EIPR1Q53HC9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EIPR1Q53HC9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EIPR1Q53HC9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EIPR1Q53HC9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
EIPR1Q53HC9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EIPR1Q53HC9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIPR1Q53HC9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIPR1Q53HC9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIPR1Q53HC9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIPR1Q53HC9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIPR1Q53HC9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIPR1Q53HC9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIPR1Q53HC9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIPR1Q53HC9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIPR1Q53HC9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIPR1Q53HC9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIPR1Q53HC9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIPR1Q53HC9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIPR1Q53HC9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIPR1Q53HC9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIPR1Q53HC9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIPR1Q53HC9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EIPR1Q53HC9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIPR1Q53HC9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIPR1Q53HC9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EIPR1Q53HC9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EIPR1Q53HC9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EIPR1Q53HC9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EIPR1Q53HC9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EIPR1Q53HC9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIPR1Q53HC9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIPR1Q53HC9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIPR1Q53HC9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIPR1Q53HC9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIPR1Q53HC9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIPR1Q53HC9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIPR1Q53HC9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIPR1Q53HC9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
EIPR1Q53HC9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIPR1Q53HC9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIPR1Q53HC9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIPR1Q53HC9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIPR1Q53HC9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIPR1Q53HC9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
EIPR1Q53HC9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIPR1Q53HC9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIPR1Q53HC9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
EIPR1Q53HC9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIPR1Q53HC9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIPR1Q53HC9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIPR1Q53HC9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EIPR1Q53HC9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EIPR1Q53HC9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIPR1Q53HC9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIPR1Q53HC9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIPR1Q53HC9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIPR1Q53HC9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIPR1Q53HC9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EIPR1Q53HC9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIPR1Q53HC9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIPR1Q53HC9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIPR1Q53HC9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIPR1Q53HC9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIPR1Q53HC9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIPR1Q53HC9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIPR1Q53HC9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIPR1Q53HC9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIPR1Q53HC9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIPR1Q53HC9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIPR1Q53HC9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIPR1Q53HC9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms