Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC0

CCDC92, Coiled-coil domain-containing protein 92, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC92Q53HC0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC92Q53HC0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC92Q53HC0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC92Q53HC0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC92Q53HC0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC92Q53HC0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC92Q53HC0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC92Q53HC0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC92Q53HC0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC92Q53HC0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC92Q53HC0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC92Q53HC0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC92Q53HC0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC92Q53HC0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC92Q53HC0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC92Q53HC0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC92Q53HC0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC92Q53HC0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC92Q53HC0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC92Q53HC0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC92Q53HC0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC92Q53HC0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC92Q53HC0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC92Q53HC0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC92Q53HC0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC92Q53HC0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC92Q53HC0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC92Q53HC0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC92Q53HC0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC92Q53HC0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC92Q53HC0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC92Q53HC0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC92Q53HC0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC92Q53HC0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC92Q53HC0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC92Q53HC0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC92Q53HC0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC92Q53HC0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC92Q53HC0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC92Q53HC0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC92Q53HC0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC92Q53HC0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC92Q53HC0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC92Q53HC0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC92Q53HC0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC92Q53HC0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC92Q53HC0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC92Q53HC0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC92Q53HC0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC92Q53HC0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC92Q53HC0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC92Q53HC0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC92Q53HC0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC92Q53HC0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC92Q53HC0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC92Q53HC0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC92Q53HC0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC92Q53HC0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC92Q53HC0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC92Q53HC0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC92Q53HC0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC92Q53HC0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC92Q53HC0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC92Q53HC0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC92Q53HC0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC92Q53HC0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC92Q53HC0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC92Q53HC0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC92Q53HC0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC92Q53HC0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC92Q53HC0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC92Q53HC0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC92Q53HC0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC92Q53HC0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC92Q53HC0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC92Q53HC0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC92Q53HC0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC92Q53HC0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC92Q53HC0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC92Q53HC0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC92Q53HC0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC92Q53HC0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC92Q53HC0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC92Q53HC0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC92Q53HC0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC92Q53HC0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC92Q53HC0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC92Q53HC0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC92Q53HC0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC92Q53HC0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC92Q53HC0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC92Q53HC0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC92Q53HC0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC92Q53HC0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC92Q53HC0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC92Q53HC0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC92Q53HC0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC92Q53HC0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC92Q53HC0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC92Q53HC0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms