Protein–RNA interactions for Protein: Q495D7

LINC01559, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01559, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01559Q495D7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC01559Q495D7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC01559Q495D7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC01559Q495D7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC01559Q495D7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC01559Q495D7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC01559Q495D7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC01559Q495D7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC01559Q495D7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC01559Q495D7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC01559Q495D7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC01559Q495D7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC01559Q495D7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC01559Q495D7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC01559Q495D7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC01559Q495D7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC01559Q495D7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC01559Q495D7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC01559Q495D7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC01559Q495D7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC01559Q495D7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC01559Q495D7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC01559Q495D7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC01559Q495D7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC01559Q495D7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC01559Q495D7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC01559Q495D7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC01559Q495D7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC01559Q495D7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC01559Q495D7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC01559Q495D7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC01559Q495D7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC01559Q495D7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC01559Q495D7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC01559Q495D7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC01559Q495D7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC01559Q495D7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC01559Q495D7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC01559Q495D7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC01559Q495D7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC01559Q495D7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC01559Q495D7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC01559Q495D7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC01559Q495D7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC01559Q495D7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC01559Q495D7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC01559Q495D7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC01559Q495D7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC01559Q495D7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC01559Q495D7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC01559Q495D7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC01559Q495D7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC01559Q495D7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC01559Q495D7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC01559Q495D7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC01559Q495D7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC01559Q495D7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC01559Q495D7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC01559Q495D7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC01559Q495D7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC01559Q495D7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC01559Q495D7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC01559Q495D7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC01559Q495D7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC01559Q495D7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC01559Q495D7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC01559Q495D7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC01559Q495D7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC01559Q495D7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC01559Q495D7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC01559Q495D7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC01559Q495D7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC01559Q495D7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC01559Q495D7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC01559Q495D7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC01559Q495D7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC01559Q495D7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC01559Q495D7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC01559Q495D7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC01559Q495D7 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC01559Q495D7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC01559Q495D7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC01559Q495D7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC01559Q495D7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC01559Q495D7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC01559Q495D7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC01559Q495D7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC01559Q495D7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC01559Q495D7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC01559Q495D7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC01559Q495D7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC01559Q495D7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC01559Q495D7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC01559Q495D7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC01559Q495D7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC01559Q495D7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC01559Q495D7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC01559Q495D7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC01559Q495D7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC01559Q495D7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms