Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SP6Q3SY56 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SP6Q3SY56 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SP6Q3SY56 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SP6Q3SY56 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SP6Q3SY56 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SP6Q3SY56 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SP6Q3SY56 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SP6Q3SY56 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SP6Q3SY56 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SP6Q3SY56 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SP6Q3SY56 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SP6Q3SY56 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SP6Q3SY56 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SP6Q3SY56 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SP6Q3SY56 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SP6Q3SY56 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SP6Q3SY56 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SP6Q3SY56 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SP6Q3SY56 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SP6Q3SY56 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SP6Q3SY56 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SP6Q3SY56 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SP6Q3SY56 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SP6Q3SY56 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SP6Q3SY56 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SP6Q3SY56 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SP6Q3SY56 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SP6Q3SY56 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SP6Q3SY56 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SP6Q3SY56 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SP6Q3SY56 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SP6Q3SY56 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SP6Q3SY56 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SP6Q3SY56 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SP6Q3SY56 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SP6Q3SY56 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SP6Q3SY56 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SP6Q3SY56 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SP6Q3SY56 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SP6Q3SY56 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SP6Q3SY56 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SP6Q3SY56 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SP6Q3SY56 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SP6Q3SY56 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SP6Q3SY56 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SP6Q3SY56 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SP6Q3SY56 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SP6Q3SY56 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SP6Q3SY56 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SP6Q3SY56 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SP6Q3SY56 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SP6Q3SY56 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SP6Q3SY56 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SP6Q3SY56 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SP6Q3SY56 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SP6Q3SY56 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SP6Q3SY56 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SP6Q3SY56 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SP6Q3SY56 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SP6Q3SY56 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SP6Q3SY56 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SP6Q3SY56 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SP6Q3SY56 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SP6Q3SY56 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SP6Q3SY56 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SP6Q3SY56 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SP6Q3SY56 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SP6Q3SY56 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SP6Q3SY56 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SP6Q3SY56 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SP6Q3SY56 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SP6Q3SY56 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SP6Q3SY56 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SP6Q3SY56 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SP6Q3SY56 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SP6Q3SY56 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SP6Q3SY56 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SP6Q3SY56 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SP6Q3SY56 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SP6Q3SY56 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SP6Q3SY56 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SP6Q3SY56 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SP6Q3SY56 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SP6Q3SY56 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SP6Q3SY56 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SP6Q3SY56 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SP6Q3SY56 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SP6Q3SY56 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SP6Q3SY56 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SP6Q3SY56 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SP6Q3SY56 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SP6Q3SY56 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SP6Q3SY56 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SP6Q3SY56 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SP6Q3SY56 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SP6Q3SY56 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SP6Q3SY56 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SP6Q3SY56 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SP6Q3SY56 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms