Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM71Q2Q1W2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM71Q2Q1W2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM71Q2Q1W2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM71Q2Q1W2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM71Q2Q1W2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM71Q2Q1W2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM71Q2Q1W2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM71Q2Q1W2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM71Q2Q1W2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM71Q2Q1W2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM71Q2Q1W2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM71Q2Q1W2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM71Q2Q1W2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM71Q2Q1W2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM71Q2Q1W2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM71Q2Q1W2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM71Q2Q1W2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM71Q2Q1W2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM71Q2Q1W2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM71Q2Q1W2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM71Q2Q1W2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM71Q2Q1W2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM71Q2Q1W2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM71Q2Q1W2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM71Q2Q1W2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM71Q2Q1W2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM71Q2Q1W2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM71Q2Q1W2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM71Q2Q1W2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM71Q2Q1W2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM71Q2Q1W2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM71Q2Q1W2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM71Q2Q1W2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM71Q2Q1W2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM71Q2Q1W2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM71Q2Q1W2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRIM71Q2Q1W2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM71Q2Q1W2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM71Q2Q1W2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM71Q2Q1W2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM71Q2Q1W2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM71Q2Q1W2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM71Q2Q1W2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM71Q2Q1W2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM71Q2Q1W2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM71Q2Q1W2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM71Q2Q1W2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM71Q2Q1W2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM71Q2Q1W2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM71Q2Q1W2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM71Q2Q1W2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM71Q2Q1W2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM71Q2Q1W2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM71Q2Q1W2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM71Q2Q1W2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM71Q2Q1W2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM71Q2Q1W2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM71Q2Q1W2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM71Q2Q1W2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM71Q2Q1W2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM71Q2Q1W2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM71Q2Q1W2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM71Q2Q1W2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM71Q2Q1W2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM71Q2Q1W2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM71Q2Q1W2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM71Q2Q1W2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM71Q2Q1W2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM71Q2Q1W2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM71Q2Q1W2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM71Q2Q1W2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TRIM71Q2Q1W2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TRIM71Q2Q1W2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TRIM71Q2Q1W2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM71Q2Q1W2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM71Q2Q1W2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM71Q2Q1W2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM71Q2Q1W2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM71Q2Q1W2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM71Q2Q1W2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM71Q2Q1W2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM71Q2Q1W2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM71Q2Q1W2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM71Q2Q1W2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM71Q2Q1W2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM71Q2Q1W2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM71Q2Q1W2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM71Q2Q1W2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM71Q2Q1W2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM71Q2Q1W2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM71Q2Q1W2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM71Q2Q1W2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM71Q2Q1W2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM71Q2Q1W2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM71Q2Q1W2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM71Q2Q1W2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM71Q2Q1W2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM71Q2Q1W2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM71Q2Q1W2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 243 ms