Protein–RNA interactions for Protein: Q2MV58

TCTN1, Tectonic-1, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCTN1Q2MV58 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TCTN1Q2MV58 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TCTN1Q2MV58 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCTN1Q2MV58 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCTN1Q2MV58 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCTN1Q2MV58 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCTN1Q2MV58 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCTN1Q2MV58 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCTN1Q2MV58 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCTN1Q2MV58 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TCTN1Q2MV58 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TCTN1Q2MV58 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TCTN1Q2MV58 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TCTN1Q2MV58 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TCTN1Q2MV58 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TCTN1Q2MV58 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TCTN1Q2MV58 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TCTN1Q2MV58 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TCTN1Q2MV58 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TCTN1Q2MV58 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TCTN1Q2MV58 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TCTN1Q2MV58 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TCTN1Q2MV58 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TCTN1Q2MV58 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TCTN1Q2MV58 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TCTN1Q2MV58 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TCTN1Q2MV58 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
TCTN1Q2MV58 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TCTN1Q2MV58 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TCTN1Q2MV58 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TCTN1Q2MV58 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TCTN1Q2MV58 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TCTN1Q2MV58 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TCTN1Q2MV58 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TCTN1Q2MV58 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TCTN1Q2MV58 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TCTN1Q2MV58 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TCTN1Q2MV58 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TCTN1Q2MV58 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TCTN1Q2MV58 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TCTN1Q2MV58 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TCTN1Q2MV58 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TCTN1Q2MV58 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TCTN1Q2MV58 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TCTN1Q2MV58 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TCTN1Q2MV58 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TCTN1Q2MV58 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TCTN1Q2MV58 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TCTN1Q2MV58 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TCTN1Q2MV58 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TCTN1Q2MV58 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCTN1Q2MV58 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCTN1Q2MV58 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCTN1Q2MV58 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCTN1Q2MV58 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCTN1Q2MV58 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TCTN1Q2MV58 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TCTN1Q2MV58 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TCTN1Q2MV58 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TCTN1Q2MV58 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TCTN1Q2MV58 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TCTN1Q2MV58 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TCTN1Q2MV58 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TCTN1Q2MV58 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TCTN1Q2MV58 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TCTN1Q2MV58 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TCTN1Q2MV58 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TCTN1Q2MV58 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TCTN1Q2MV58 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TCTN1Q2MV58 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TCTN1Q2MV58 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TCTN1Q2MV58 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TCTN1Q2MV58 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TCTN1Q2MV58 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TCTN1Q2MV58 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TCTN1Q2MV58 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TCTN1Q2MV58 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TCTN1Q2MV58 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TCTN1Q2MV58 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TCTN1Q2MV58 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TCTN1Q2MV58 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TCTN1Q2MV58 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TCTN1Q2MV58 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TCTN1Q2MV58 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TCTN1Q2MV58 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TCTN1Q2MV58 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TCTN1Q2MV58 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TCTN1Q2MV58 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TCTN1Q2MV58 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TCTN1Q2MV58 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TCTN1Q2MV58 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TCTN1Q2MV58 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TCTN1Q2MV58 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TCTN1Q2MV58 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TCTN1Q2MV58 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TCTN1Q2MV58 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TCTN1Q2MV58 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TCTN1Q2MV58 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TCTN1Q2MV58 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TCTN1Q2MV58 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms