Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KNOP1Q1ED39 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KNOP1Q1ED39 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KNOP1Q1ED39 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KNOP1Q1ED39 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KNOP1Q1ED39 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KNOP1Q1ED39 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KNOP1Q1ED39 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
KNOP1Q1ED39 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KNOP1Q1ED39 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KNOP1Q1ED39 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KNOP1Q1ED39 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KNOP1Q1ED39 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KNOP1Q1ED39 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KNOP1Q1ED39 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KNOP1Q1ED39 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KNOP1Q1ED39 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KNOP1Q1ED39 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KNOP1Q1ED39 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KNOP1Q1ED39 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KNOP1Q1ED39 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KNOP1Q1ED39 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KNOP1Q1ED39 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KNOP1Q1ED39 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KNOP1Q1ED39 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KNOP1Q1ED39 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KNOP1Q1ED39 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KNOP1Q1ED39 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KNOP1Q1ED39 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KNOP1Q1ED39 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KNOP1Q1ED39 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KNOP1Q1ED39 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KNOP1Q1ED39 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KNOP1Q1ED39 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KNOP1Q1ED39 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
KNOP1Q1ED39 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
KNOP1Q1ED39 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KNOP1Q1ED39 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KNOP1Q1ED39 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KNOP1Q1ED39 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KNOP1Q1ED39 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KNOP1Q1ED39 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KNOP1Q1ED39 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
KNOP1Q1ED39 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KNOP1Q1ED39 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KNOP1Q1ED39 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KNOP1Q1ED39 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KNOP1Q1ED39 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KNOP1Q1ED39 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KNOP1Q1ED39 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KNOP1Q1ED39 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
KNOP1Q1ED39 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KNOP1Q1ED39 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KNOP1Q1ED39 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KNOP1Q1ED39 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KNOP1Q1ED39 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KNOP1Q1ED39 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KNOP1Q1ED39 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
KNOP1Q1ED39 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KNOP1Q1ED39 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KNOP1Q1ED39 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KNOP1Q1ED39 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KNOP1Q1ED39 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KNOP1Q1ED39 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KNOP1Q1ED39 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KNOP1Q1ED39 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KNOP1Q1ED39 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KNOP1Q1ED39 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KNOP1Q1ED39 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KNOP1Q1ED39 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KNOP1Q1ED39 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KNOP1Q1ED39 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KNOP1Q1ED39 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KNOP1Q1ED39 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KNOP1Q1ED39 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KNOP1Q1ED39 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KNOP1Q1ED39 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KNOP1Q1ED39 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KNOP1Q1ED39 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KNOP1Q1ED39 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KNOP1Q1ED39 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KNOP1Q1ED39 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KNOP1Q1ED39 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KNOP1Q1ED39 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KNOP1Q1ED39 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
KNOP1Q1ED39 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KNOP1Q1ED39 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KNOP1Q1ED39 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KNOP1Q1ED39 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KNOP1Q1ED39 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KNOP1Q1ED39 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KNOP1Q1ED39 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KNOP1Q1ED39 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KNOP1Q1ED39 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KNOP1Q1ED39 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
KNOP1Q1ED39 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
KNOP1Q1ED39 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KNOP1Q1ED39 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KNOP1Q1ED39 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KNOP1Q1ED39 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
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