Protein–RNA interactions for Protein: Q16649

NFIL3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIL3Q16649 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NFIL3Q16649 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NFIL3Q16649 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NFIL3Q16649 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NFIL3Q16649 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NFIL3Q16649 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NFIL3Q16649 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NFIL3Q16649 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NFIL3Q16649 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NFIL3Q16649 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NFIL3Q16649 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NFIL3Q16649 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NFIL3Q16649 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NFIL3Q16649 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NFIL3Q16649 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NFIL3Q16649 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NFIL3Q16649 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NFIL3Q16649 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NFIL3Q16649 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NFIL3Q16649 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NFIL3Q16649 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NFIL3Q16649 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NFIL3Q16649 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NFIL3Q16649 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NFIL3Q16649 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NFIL3Q16649 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NFIL3Q16649 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NFIL3Q16649 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NFIL3Q16649 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NFIL3Q16649 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFIL3Q16649 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFIL3Q16649 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFIL3Q16649 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NFIL3Q16649 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFIL3Q16649 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFIL3Q16649 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NFIL3Q16649 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NFIL3Q16649 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NFIL3Q16649 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NFIL3Q16649 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NFIL3Q16649 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NFIL3Q16649 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NFIL3Q16649 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
NFIL3Q16649 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NFIL3Q16649 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NFIL3Q16649 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NFIL3Q16649 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NFIL3Q16649 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NFIL3Q16649 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NFIL3Q16649 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NFIL3Q16649 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NFIL3Q16649 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NFIL3Q16649 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NFIL3Q16649 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NFIL3Q16649 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NFIL3Q16649 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NFIL3Q16649 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NFIL3Q16649 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NFIL3Q16649 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NFIL3Q16649 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NFIL3Q16649 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NFIL3Q16649 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NFIL3Q16649 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NFIL3Q16649 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NFIL3Q16649 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NFIL3Q16649 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NFIL3Q16649 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NFIL3Q16649 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NFIL3Q16649 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NFIL3Q16649 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NFIL3Q16649 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NFIL3Q16649 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NFIL3Q16649 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NFIL3Q16649 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NFIL3Q16649 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NFIL3Q16649 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NFIL3Q16649 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NFIL3Q16649 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NFIL3Q16649 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NFIL3Q16649 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NFIL3Q16649 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NFIL3Q16649 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NFIL3Q16649 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NFIL3Q16649 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NFIL3Q16649 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NFIL3Q16649 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NFIL3Q16649 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
NFIL3Q16649 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NFIL3Q16649 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NFIL3Q16649 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NFIL3Q16649 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NFIL3Q16649 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NFIL3Q16649 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NFIL3Q16649 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NFIL3Q16649 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
NFIL3Q16649 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NFIL3Q16649 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NFIL3Q16649 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NFIL3Q16649 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NFIL3Q16649 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
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